Accession
MI0001757
Description
Saccharum officinarum
sof-MIR159b precursor miRNA
Gene family
MIPF0000010;
MIR159
Literature search
7 open access papers mention sof-MIR159b
(39 sentences)
(39 sentences)
Sequence
ccugaugcuuggauuugaagcggagcuccuaucauuccaaugaagggccguucugaagggugguuccgcugcucguucaugguucccacuauccuaucucaucauguauguguguauguauuuucggagagggaggagaggagcuagacucucacgguggucgucuuugagauaggcuugugguuugcaugaccgaggagcugcaccguccccuugcuggccgcucUUUGGAUUGAAGGGAGCUCUGcauccugaaccauccaucc
...((((..(((.((.((.(((((((((((.(((.(((((.((..(((((.....(((((((((.(.(((.((((.(((((....((((...(((((((((............(.(((.(((.((((((((..((........))...))))).))).)))))))..)))))))))...))))....))))).)))).))).).))))..)))))..)))))..)).))))).))).))))))))))).))..)).)))..)))).
...((((..(((.((.((.(((((((((((.(((.(((((.((..(((((.....(((((((((.(.(((.((((.(((((....((((...(((((((((............(.(((.(((.((((((((..((........))...))))).))).)))))))..)))))))))...))))....))))).)))).))).).))))..)))))..)))))..)).))))).))).))))))))))).))..)).)))..)))).
Structure
ccu cu a -u a a u u ag uucug -- u c g u guuc uau ucauguaugugu u u u - -gg gag gaug ugg uu ga gcggagcuccu uca uccaa ga ggccg aaggg uggu c gcu cucg ucaug ccac ccuaucuca g aug auu ucg gagag ag a |||| ||| || || ||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||| | ||| |||| ||||| |||| ||||||||| | ||| ||| ||| ||||| || cuac acc ag cu cGUCUCGAGGG AGU AGGUU cu ccggu uuccc gcca g cga gagc aguac ggug ggauagagu c ugc ugg ggc cucuc uc g --c cu a uc a A U U cg ---cg cu c u g c guuu uuc ----------uu - - u a aga gag
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
Unknown
Database links
Mature sof-miR159b
| Accession | MIMAT0001659 |
| Description | Saccharum officinarum sof-miR159b mature miRNA |
| Sequence | 227 - UUUGGAUUGAAGGGAGCUCUG - 247 |
| Evidence | not_experimental |
References
|
