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miRBase |
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Stem-loop sequence rno-mir-369 |
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Accession | MI0003551 (change log) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Rattus norvegicus miR-369 stem-loop | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene family | MIPF0000018; mir-154 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature search |
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8 open access papers mention rno-mir-369 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Stem-loop |
u ag ua cuu c 5' gguacu ga ggagaucgaccgugu uauucg ag u |||||| || ||||||||||||||| |||||| || 3' cuauga cu uuucuaguugguaca auaagc uc g - cu ua --u a |
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Deep sequencing |
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Confidence |
Annotation confidence: high
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Genome context |
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Clustered miRNAs |
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Database links |
Mature sequence rno-miR-369-5p |
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Accession | MIMAT0003206 |
Sequence |
14 - agaucgaccguguuauauucgc - 35 |
Deep sequencing | 86499 reads, 389 experiments |
Evidence | experimental; cloned [2], SOLiD [3] |
Predicted targets |
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Mature sequence rno-miR-369-3p |
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Accession | MIMAT0003207 |
Sequence |
49 - aauaauacaugguugaucuuu - 69 |
Deep sequencing | 59519 reads, 386 experiments |
Evidence | experimental; cloned [2], SOLiD [3] |
Predicted targets |
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References |
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1 |
PMID:16274478
"Identification of clustered microRNAs using an ab initio prediction method"
BMC Bioinformatics. 6:267(2005).
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2 |
PMID:17604727
"A mammalian microRNA expression atlas based on small RNA library sequencing"
Cell. 129:1401-1414(2007).
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3 |
PMID:20403161
"Small RNA expression and strain specificity in the rat"
BMC Genomics. 11:249(2010).
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