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miRBase |
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Stem-loop sequence mmu-mir-466c-1 |
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Accession | MI0005505 (change log) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Previous IDs | mmu-mir-466c | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Symbol | MGI:Mir466c-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Mus musculus miR-466c-1 stem-loop | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene family | MIPF0000208; mir-466 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature search |
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27 open access papers mention mmu-mir-466c-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stem-loop |
--g -g c ca aau 5' uauauguguu augugugugug augua uaugug a |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| u 3' guauacacag uacacacgcac uacau auacau g cga aa a -- aua |
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Deep sequencing |
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Confidence |
Annotation confidence: not enough data
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Genome context |
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Clustered miRNAs |
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Database links |
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Mature sequence mmu-miR-466c-5p |
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Accession | MIMAT0004877 |
Sequence |
11 - ugaugugugugugcauguacauau - 34 |
Deep sequencing | 31110 reads, 95 experiments |
Evidence | experimental; Illumina [1] |
Mature sequence mmu-miR-466c-3p |
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Accession | MIMAT0004878 |
Sequence |
52 - auacauacacgcacacauaaga - 73 |
Deep sequencing | 70338 reads, 102 experiments |
Evidence | experimental; Illumina [1] |
References |
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1 |
PMID:17604727
"A mammalian microRNA expression atlas based on small RNA library sequencing"
Cell. 129:1401-1414(2007).
|
2 |
PMID:20215419
"MicroRNA transcriptome in the newborn mouse ovaries determined by massive parallel sequencing"
Mol Hum Reprod. 16:463-471(2010).
|
3 |
PMID:20413612
"Mammalian microRNAs: experimental evaluation of novel and previously annotated genes"
Genes Dev. 24:992-1009(2010).
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