![]() |
miRBase |
![]() |
![]() |
Stem-loop sequence rno-mir-410 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | MI0006143 (change log) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Rattus norvegicus miR-410 stem-loop | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene family | MIPF0000018; mir-154 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature search |
![]()
9 open access papers mention rno-mir-410 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Stem-loop |
--ac g ug a a - uuu 5' uugagga aggu ucugug ug guucg c a ||||||| |||| |||||| || ||||| | u 3' aacuuuu uccg agacac au uaagc g u ccau g gu a a a uaa |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Confidence |
Annotation confidence: high
| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Database links |
Mature sequence rno-miR-410-5p |
|
Accession | MIMAT0017303 |
Previous IDs | rno-miR-410* |
Sequence |
11 - agguugucugugaugaguucg - 31 |
Deep sequencing | 191 reads, 72 experiments |
Evidence | experimental; SOLiD [2] |
Predicted targets |
|
Mature sequence rno-miR-410-3p |
|
Accession | MIMAT0005311 |
Previous IDs | rno-miR-410 |
Sequence |
46 - aauauaacacagauggccugu - 66 |
Deep sequencing | 741004 reads, 474 experiments |
Evidence | experimental; cloned [1], SOLiD [2] |
Predicted targets |
|
References |
|
1 |
PMID:17604727
"A mammalian microRNA expression atlas based on small RNA library sequencing"
Cell. 129:1401-1414(2007).
|
2 |
PMID:20403161
"Small RNA expression and strain specificity in the rat"
BMC Genomics. 11:249(2010).
|