Accession
MI0006224
Description
Chlamydomonas reinhardtii
cre-MIR1163 precursor miRNA
Sequence
auugacaacgcgcccgagcgccggcgcaccggcaagaacaaggacaaguaugagaugcugccguaccccggcaacacgcucauggaugaggcugaccugaAGGGCAUGCUGCGUGCCAUGGcgcccuucaucgugcgcgcauagggucuuaacugccagguugaagucgcacacgcggaagaccuugcugccaucaggcgcgaugucguacagcagguuggcgggcuucaggucaaagugcauguagccgcgagcguucaggugcuuugaugAAGAGCGCCAUGGCACGCAGCaugcccuucaggucggccucauccauaagcguguugccgggguacggcagcaucucaaacuuguccuuguucuugccggugcgccggcgcucgggcgcguugucaau
(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((.((((......(((.......)))...(((((..(((...(((((..(((.((((.(((....))))))).))).(((((((..(((((.........)))))..))).)))).))))).))))))))))))..)))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((.((((......(((.......)))...(((((..(((...(((((..(((.((((.(((....))))))).))).(((((((..(((((.........)))))..))).)))).))))).))))))))))))..)))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
Structure
a c c -u gcauagggucuuaacugccagg gu aca aagaccuugcugccaucaggcgcgaugucg - gg ggg
auugacaacgcgcccgagcgccggcgcaccggcaagaacaaggacaagu ugagaugcugccguaccccggcaacacgcu auggaugaggcugaccugaAGGGCAUGCUGCGUGCCAUGGcgc cuucaucg gcgc uugaa cgc cgcgg uaca gca uuggc c
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||| ||| ||||| u
uaacuguugcgcgggcucgcggccgcguggccguucuuguuccuguuca acucuacgacggcauggggccguugugcga uaccuacuccggcuggacuucccguaCGACGCACGGUACCGCG GAAguagu cgug gacuu gcg gcgcc augu cgu aacug u
a a A uu ---------------------- -- --a -----------------------------g a ga gac
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold_31: 330020-330419 [+]
Database links
Mature cre-miR1163.2
| Accession | MIMAT0005417 |
| Description | Chlamydomonas reinhardtii cre-miR1163.2 mature miRNA |
| Sequence | 101 - AGGGCAUGCUGCGUGCCAUGG - 121 |
| Evidence |
experimental
cloned [1] |
Mature cre-miR1163.1
| Accession | MIMAT0005418 |
| Description | Chlamydomonas reinhardtii cre-miR1163.1 mature miRNA |
| Sequence | 273 - AAGAGCGCCAUGGCACGCAGC - 293 |
| Evidence |
experimental
cloned [1] |
References
|
