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miRBase |
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Stem-loop sequence osa-MIR2118l |
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Accession | MI0011262 (change log) | |||||||||||||||||||||||||||||
Description | Oryza sativa miR2118l stem-loop | |||||||||||||||||||||||||||||
Gene family | MIPF0000745; MIR2118 | |||||||||||||||||||||||||||||
Literature search |
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28 open access papers mention osa-MIR2118l | |||||||||||||||||||||||||||||
Stem-loop |
g uu aaauu g - a a cu uauuuucu aga 5' agc ag aggaagaggaag gagugucuaa aacagugggaaugg aa cauua ggaaagc acag ucuccacu a ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||| u 3' ucg uu uccuucuccuuc cucauagauu uuguuauccuuacc uu guaau ccuuuug uguu agaggugg u g -u ----- g c c - -- uucuuaau gga |
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Deep sequencing |
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Confidence |
Annotation confidence: not enough data
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Genome context |
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Clustered miRNAs |
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Database links |
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Mature sequence osa-miR2118l |
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Accession | MIMAT0011751 |
Sequence |
121 - uuccuaaugcuucccauuccua - 142 |
Evidence | experimental; 454 [1] |
References |
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1 |
PMID:19584097
"Clusters and superclusters of phased small RNAs in the developing inflorescence of rice"
Genome Res. 19:1429-1440(2009).
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