Accession
MI0019252
Description
Arabidopsis thaliana
ath-MIR5645f precursor miRNA
Sequence
cggaagacaaauaaaucguauaguuuuuguuguuuuucaaaauaaaugacaaaguuuuuguugaguugucAUUUGAGUCAUGUCGUUAAGuagguuaacagaauuuuuuuacggcguuaaugucucguuuaucuccuauguuagaacaaaacaacguucuucauugcagcucguuuugucuguugaaacaaauuuaaacccuaaaucccuaaaucgauuucauuaucugcgauuuugaggucaaugugggucucugauuuugagauaaugaaaucaauuugggaaauuaggguuuauauuuguuucaaaagacaaaacaacgucguuucgucucugcaauaaacgacguuguuuuguucuaacaaaguaaauaaacaagacauuaacgccguaaaaaaauuuuuuaacuuauuuaaugauaucucaaauggcaagucaacaaaaacuugucauuuauuucgaaagucaacaaaaacuugucgauuuauuugucuucugu
((((((((((((((((((...(((((((((((.(((((.(((((((((((((.(((((((((((.((((((((((((..(((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((.((((((...((.((((((((((((((((((((.((.(((((((...(((((((((.(((((((((((.((((((((((...(((((((.(((((((((((((.(((..((((((((......)))))).))..)))))))))))))))).)))))))...)))))))))).))))))))))).))))))))).(((......)))..))))))).)).)))))))))))))))))))).))...)))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))).))))).)))))))))))...)))))))))))))))))).
((((((((((((((((((...(((((((((((.(((((.(((((((((((((.(((((((((((.((((((((((((..(((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((.((((((...((.((((((((((((((((((((.((.(((((((...(((((((((.(((((((((((.((((((((((...(((((((.(((((((((((((.(((..((((((((......)))))).))..)))))))))))))))).)))))))...)))))))))).))))))))))).))))))))).(((......)))..))))))).)).)))))))))))))))))))).))...)))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))).))))).)))))))))))...)))))))))))))))))).
Structure
- uau u a a g UC c c cuc a c c ------------cuc g u auc c g uu - aa cggaagacaaauaaaucg aguuuuuguug uuuuc aaauaaaugacaa guuuuuguuga uugucAUUUGAG AUGUCGUUAAGuagguuaa agaauuuuuuuacggcguuaaugucu guuuau cu uguuagaacaaaacaacguu uu auugcag guuuugucu uugaaacaaau uaaacccuaa ccuaaau gauuucauuaucu cga uu gagguc u |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |||||| gucuucuguuuauuuagc ucaaaaacaac gaaag uuuauuuacuguu caaaaacaacu aacgguaaacuc uauaguaauuuauucaauu uuuuaaaaaaaugccgcaauuacaga caaaua ga acaaucuuguuuuguugcag aa uaacguc caaaacaga aacuuuguuua auuugggauu ggguuua cuaaaguaauaga guu ag cucugg g u ugu u c - g -- - a aau a c a ucugcuuugcugcaa a u aaa a - uu u gu
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr5: 14946671-14947169 [-]
Database links
Mature ath-miR5645f
| Accession | MIMAT0022441 |
| Description | Arabidopsis thaliana ath-miR5645f mature miRNA |
| Sequence | 71 - AUUUGAGUCAUGUCGUUAAG - 90 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
