Accession
MI0021357
Description
Nicotiana tabacum
nta-MIR169a precursor miRNA
Gene family
MIPF0000037;
MIR169_2
Literature search
4 open access papers mention nta-MIR169a
(16 sentences)
(16 sentences)
Sequence
gaguggauugCAGCCAAGGAUGACUUGCCGAgauguuguagccaaugcaaugacuuaucggcaggucguccuuggcuacauuuuacucucuucugcucauguaaggcucugaaagacauauauaauucgaggugaagucagugauugaguuucacaaaucacauccaauugaauugcucaugauuugucuagagagucauugcaagaaaagguagggaguggauugcagccaagaaugacuugccgagauguuguagccaaugcaaugacuuauuggcaggucguccuuggcuacauuuuacucucu
(((((((.((.((((((((((((((((((((...(((((.((....((.(((((...((((((((((((.(((((((.((.(((((((((((((..((.(((((((((((...((((((((.((((((((((((..((..((((.......))))..))..))))...))))))))...)))...)))))..)))))).))))).))..))).)))))))))).)).))))))).))))))))))))...))))).))....)).)))))...)))))))))))))))))))).)).)))))))...
(((((((.((.((((((((((((((((((((...(((((.((....((.(((((...((((((((((((.(((((((.((.(((((((((((((..((.(((((((((((...((((((((.((((((((((((..((..((((.......))))..))..))))...))))))))...)))...)))))..)))))).))))).))..))).)))))))))).)).))))))).))))))))))))...))))).))....)).)))))...)))))))))))))))))))).)).)))))))...
Structure
--- u C gau a caau a uua c a u - gc a - gaa --- --a --- aa ca uu gagugga ug AGCCAAGGAUGACUUGCCGA guugu gc gc augac ucggcaggucgu cuuggcu ca uuuacucucu ucu uc uguaa ggcucu agaca uau uaauucga ggug gu guga g ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||| || |||| a cucauuu ac ucgguuccugcuggacgguu cagua cg cg uguug agccguucagua gaaccga gu aggugaggga gga ag acguu cugaga ucugu gua guuaaguu cuac ua cacu g ucu u a auu a uaac a uag a c u u aa a a -ga uua cuc aac ac aa uu
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
Unknown
Database links
Mature nta-miR169a
| Accession | MIMAT0024667 |
| Description | Nicotiana tabacum nta-miR169a mature miRNA |
| Sequence | 11 - CAGCCAAGGAUGACUUGCCGA - 31 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
