Accession
MI0027442
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8564 precursor miRNA
Sequence
146
reads,
613
reads per million, 4 experiments
uauauauacgaaaaaagcugggauuagcucacuaauucauaugaacauaugaguccaacgguccagaaugaaucugggccgauccgacggucucgacuccauuucguguuugaauuuuaauuuuuuuuuuuacacauccaaaucauuugauguuuuuuuuucaucaagguguacucaauuuuggauuuguagaaaaaaaauuaaaauucaaacacuaucgaacaucgaugaucguuagaucaauucauauucaauuugAGCUGUUGGGCUCAUAUGUUCAUAugagcuaguggguuaauccuagcuuuauauauauauaua
((((((((.....(((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.((((.(((((.((((..((((.(((((((((((.........(((((((((((((((((((((((((.(((.(((((((...(((((((.........)))))))...........))))))).)))))))))))))))))))))))))))).........)))).))))))).))))..)))).))))).)))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))).....))))))))
((((((((.....(((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.((((.(((((.((((..((((.(((((((((((.........(((((((((((((((((((((((((.(((.(((((((...(((((((.........)))))))...........))))))).)))))))))))))))))))))))))))).........)))).))))))).))))..)))).))))).)))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))).....))))))))
Structure
cgaaa a c a c cc c - cuccauuuc u c --------uca uuu
uauauaua aaagcugggauuagcucacua uucauaugaacauaugaguccaacggu caga ugaau uggg gauc gacgguc ucga guguuugaauuuuaauuuuuuuuuu aca auccaaa uuugaug u
|||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| u
auauauau uuucgauccuaauugggugau gaguAUACUUGUAUACUCGGGUUGUCG guuu acuua acuu cuag uugcuag agcu cacaaacuuaaaauuaaaaaaaaga ugu uagguuu gaacuac u
auaua c A a u aa a u acaagcuau - u uaacucaugug uuu
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00021: 1421188-1421508 [+]
Database links
Mature atr-miR8564
| Accession | MIMAT0033840 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8564 mature miRNA |
| Sequence | 259 - AGCUGUUGGGCUCAUAUGUUCAUA - 282 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
