Accession
MI0027482
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8565h precursor miRNA
Gene family
MIPF0001889;
MIR8565
Sequence
788
reads,
590
reads per million, 4 experiments
guaauuuuguuauucaauuauguuaguauuuauuuuaugaguaauuaucuuaugagacccuuccacacucauguaugcuggacuucaaaggaucaaccAUUAAAUUUGGCAUAGAUCUUUAGaaaaguuaucacaugacugugaaauuugacuuucuuagagaucugugucaaauuuaaugguaaucuuuugggguccuacacacaugggugaggaggaucuuacaaggucauuucucuuguuuuauuuaggugauuuggaauuuauauauaauuuaugguuauuac
(((((...((((((((...(((........)))....)))))))).(((((.(((((.(((.((.(((((((((.((..((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((....)))))....))))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))..)).))))))))).))))).))))).)))))((..((.((((.......)))).))..))(((((.......)))))......)))))
(((((...((((((((...(((........)))....)))))))).(((((.(((((.(((.((.(((((((((.((..((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((....)))))....))))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))..)).))))))))).))))).))))).)))))((..((.((((.......)))).))..))(((((.......)))))......)))))
Structure
-----------uuuguuauucaauuauguuaguauuuauuuuaugaguaauu a c u a a cu ca a ---- u
guaau aucuu ugaga ccu cc cacucaugu ug ggacuucaaaggau accAUUAAAUUUGGCAUAGAUCUUUAG aaaguua ucaca g
||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
cauua uggaa auucu gga gg guggguaca ac ccugggguuuucua ugguaauuuaaacugugucuagagauu uuucagu agugu a
uugguauuuaauauauauuuaagguuuaguggauuuauuuuguucucuuuac c a - a c au -a c uuaa c
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00076: 816642-816928 [-]
Database links
Mature atr-miR8565h
| Accession | MIMAT0033881 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8565h mature miRNA |
| Sequence | 99 - AUUAAAUUUGGCAUAGAUCUUUAG - 122 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
