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miRBase |
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Stem-loop sequence rno-mir-3543-2 |
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Accession | MI0031768 (change log) | |||||||||||||||||||
Description | Rattus norvegicus miR-3543-2 stem-loop | |||||||||||||||||||
Gene family | MIPF0002097; mir-3543 | |||||||||||||||||||
Stem-loop |
u caaa -------a g ---- ca g -a u 5' gauu ccagg gucga uga ugguu aaccac aguuugac auggu c |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||| ||||| 3' cuga ggucc cagcu acu accaa uuggug ucgagcug uacca a a ---- aaacuuug a gaga ac - ag a |
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Deep sequencing |
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Confidence |
Annotation confidence: not enough data
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Genome context |
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Clustered miRNAs |
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Database links |
Mature sequence rno-miR-3543 |
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Accession | MIMAT0017797 |
Sequence |
11 - caggagucgagugaugguucaaa - 33 |
Evidence | experimental; SOLiD [1] |
References |
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1 |
PMID:20403161
"Small RNA expression and strain specificity in the rat"
BMC Genomics. 11:249(2010).
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