Pristionchus pacificus miRNAs (124 sequences)

ID Accession RPM Chromosome Start End Strand Fetch
ppc-let-7 MI0011149 6.88e+03 Ppa_Contig31
 197569
 197679
 +
ppc-lin-4 MI0011136 1.12e+04 Ppa_Contig61
 388674
 388782
 +
ppc-mir-1 MI0011127 - Ppa_Contig101
 361557
 361660
 -
ppc-mir-2 MI0011226 1.68e+04 Ppa_Contig106
 140705
 140812
 +
ppc-mir-9 MI0011248 4.91e+03 Ppa_Contig177
 208085
 208189
 -
ppc-mir-37 MI0011135 1.42e+03 Ppa_Contig9
 1712643
 1712733
 -
ppc-mir-38 MI0011218 546 Ppa_Contig89
 123474
 123571
 +
ppc-mir-42a MI0011129 4.7e+03 Ppa_Contig112
 331735
 331839
 -
ppc-mir-42b MI0011145 218 Ppa_Contig89
 123598
 123688
 +
ppc-mir-45 MI0011128 1.07e+04 Ppa_Contig112
 331568
 331663
 -
ppc-mir-46 MI0011147 1.14e+04 Ppa_Contig7
 1271994
 1272104
 +
ppc-mir-54 MI0011198 3.06e+03 Ppa_Contig0
 2088313
 2088432
 +
ppc-mir-55a MI0011220 1.08e+05 Ppa_Contig45
 455749
 455868
 +
ppc-mir-55b MI0011199 983
ppc-mir-56 MI0011221 1.86e+03 Ppa_Contig45
 455901
 456006
 +
ppc-mir-63a MI0011150 9.39e+03 Ppa_Contig31
 608794
 608913
 -
ppc-mir-63b MI0011138 1.32e+04 Ppa_Contig21
 1203087
 1203203
 +
ppc-mir-63c-1 MI0011139 1.29e+04 Ppa_Contig21
 1203247
 1203349
 +
ppc-mir-63c-2 MI0011140 1.29e+04 Ppa_Contig21
 1203389
 1203504
 +
ppc-mir-63c-3 MI0011141 1.29e+04 Ppa_Contig21
 1203538
 1203653
 +
ppc-mir-63c-4 MI0011142 1.29e+04 Ppa_Contig21
 1203687
 1203802
 +
ppc-mir-63d MI0011152 7.86e+03 Ppa_Contig28
 883870
 883971
 -
ppc-mir-63e MI0011170 546 Ppa_Contig28
 883010
 883110
 -
ppc-mir-63f MI0011157 218 Ppa_Contig21
 1203841
 1203942
 +
ppc-mir-63g MI0011130 2.4e+03 Ppa_Contig28
 884551
 884645
 -
ppc-mir-63h MI0011171 1.27e+04 Ppa_Contig28
 884077
 884185
 -
ppc-mir-65 MI0011158 109 Ppa_Contig31
 851175
 851271
 +
ppc-mir-67 MI0011216 328 Ppa_Contig39
 314720
 314825
 +
ppc-mir-71 MI0011151 765 Ppa_Contig64
 1002722
 1002834
 -
ppc-mir-72 MI0011154 1.53e+03 Ppa_Contig40
 365199
 365307
 -
ppc-mir-79 MI0011143 1.28e+04 Ppa_Contig177
 113142
 113237
 +
ppc-mir-81 MI0011148 4.14e+05 Ppa_Contig41
 615068
 615153
 -
ppc-mir-84a MI0011159 437 Ppa_Contig84
 219423
 219538
 +
ppc-mir-84b MI0011144 983 Ppa_Contig84
 219701
 219803
 +
ppc-mir-86 MI0011155 7.97e+03 Ppa_Contig46
 799889
 799993
 -
ppc-mir-87 MI0011132 983 Ppa_Contig87
 188151
 188248
 -
ppc-mir-124 MI0011133 765 Ppa_Contig144
 517932
 518033
 -
ppc-mir-232 MI0011202 874 Ppa_Contig319
 9757
 9854
 +
ppc-mir-234 MI0011197 1.86e+03 Ppa_Contig9
 495761
 495876
 -
ppc-mir-236 MI0011165 1.64e+03 Ppa_Contig65
 75168
 75282
 -
ppc-mir-239-1 MI0011134 1.46e+04 Ppa_Contig157
 207151
 207256
 -
ppc-mir-239-2 MI0011146 1.46e+04 Ppa_Contig5
 1004187
 1004301
 +
ppc-mir-240 MI0011228 1.75e+03 Ppa_Contig140
 224065
 224181
 -
ppc-mir-242 MI0011156 328 Ppa_Contig98
 243790
 243909
 -
ppc-mir-252 MI0011137 - Ppa_Contig63
 489002
 489106
 +
ppc-mir-279 MI0011244 874 Ppa_Contig106
 140551
 140654
 +
ppc-mir-312 MI0011208 765 Ppa_Contig73
 118231
 118326
 +
ppc-mir-993 MI0011222 3.49e+03 Ppa_Contig46
 1204478
 1204597
 +
ppc-mir-2232-1 MI0011131 1.16e+05 Ppa_Contig31
 608462
 608561
 -
ppc-mir-2232-2 MI0011153 1.53e+05 Ppa_Contig4
 1507748
 1507867
 -
ppc-mir-2233 MI0011242 6.12e+03 Ppa_Contig180
 297969
 298067
 +
ppc-mir-2234a MI0011163 - Ppa_Contig63
 318772
 318891
 -
ppc-mir-2234b MI0011164 109 Ppa_Contig63
 318897
 319011
 -
ppc-mir-2235-1 MI0011174 655 Ppa_Contig184
 56991
 57080
 -
ppc-mir-2235-2 MI0011175 655 Ppa_Contig184
 57215
 57304
 -
ppc-mir-2235-3 MI0011176 655 Ppa_Contig184
 57439
 57528
 -
ppc-mir-2235-4 MI0011177 655 Ppa_Contig184
 57663
 57752
 -
ppc-mir-2235-5 MI0011178 655 Ppa_Contig184
 57887
 57976
 -
ppc-mir-2235-6 MI0011179 655 Ppa_Contig184
 58412
 58501
 -
ppc-mir-2235-7 MI0011180 655 Ppa_Contig184
 58637
 58726
 -
ppc-mir-2235-8 MI0011181 655 Ppa_Contig184
 58863
 58949
 -
ppc-mir-2236a MI0011183 546 Ppa_Contig154
 421543
 421634
 -
ppc-mir-2236b MI0011184 1.97e+03 Ppa_Contig154
 421712
 421803
 -
ppc-mir-2237a MI0011205 874 Ppa_Contig2
 1443971
 1444061
 +
ppc-mir-2237b MI0011206 - Ppa_Contig2
 1444727
 1444818
 +
ppc-mir-2237c MI0011233 1.75e+03 Ppa_Contig2
 1444093
 1444183
 +
ppc-mir-2238a-1 MI0011193 2.29e+03 Ppa_Contig6
 719178
 719295
 -
ppc-mir-2238a-2 MI0011194 2.29e+03 Ppa_Contig6
 1210593
 1210703
 -
ppc-mir-2238a-3 MI0011195 2.29e+03 Ppa_Contig6
 1507482
 1507578
 -
ppc-mir-2238a-4 MI0011224 2.29e+03 Ppa_Contig6
 1027818
 1027937
 +
ppc-mir-2238b-1 MI0011182 1.2e+03 Ppa_Contig39
 729859
 729970
 -
ppc-mir-2238b-2 MI0011217 1.2e+03 Ppa_Contig39
 506080
 506170
 +
ppc-mir-2238c MI0011196 1.53e+03 Ppa_Contig6
 1864856
 1864961
 -
ppc-mir-2238d MI0011213 874 Ppa_Contig129
 131258
 131359
 +
ppc-mir-2238e MI0011223 3.6e+03 Ppa_Contig6
 915545
 915641
 +
ppc-mir-2239-1 MI0011232 1.42e+03 Ppa_Contig13
 928461
 928576
 -
ppc-mir-2239-2 MI0011245 1.42e+03 Ppa_Contig1757
 890
 1005
 +
ppc-mir-2240a-1 MI0011190 874 Ppa_Contig6
 626376
 626472
 -
ppc-mir-2240a-2 MI0011191 874 Ppa_Contig6
 626503
 626599
 -
ppc-mir-2240b MI0011189 1.2e+03 Ppa_Contig6
 626254
 626343
 -
ppc-mir-2240c MI0011192 1.97e+03 Ppa_Contig6
 626622
 626736
 -
ppc-mir-2241a-1 MI0011246 1.53e+03 Ppa_Contig51
 325988
 326075
 -
ppc-mir-2241a-2 MI0011247 1.53e+03 Ppa_Contig25
 40539
 40626
 +
ppc-mir-2241a-3 MI0011236 1.53e+03 Ppa_Contig25
 39974
 40091
 +
ppc-mir-2241a-4 MI0011238 1.53e+03 Ppa_Contig25
 40258
 40354
 +
ppc-mir-2241a-5 MI0011240 1.53e+03 Ppa_Contig51
 326119
 326206
 -
ppc-mir-2241b-1 MI0011250 1.04e+04 Ppa_Contig25
 40120
 40216
 +
ppc-mir-2241b-2 MI0011237 1.04e+04 Ppa_Contig51
 326529
 326625
 -
ppc-mir-2241b-3 MI0011239 1.04e+04 Ppa_Contig25
 40396
 40492
 +
ppc-mir-2241c MI0011249 3.71e+03 Ppa_Contig51
 326391
 326487
 -
ppc-mir-2242-1 MI0011210 765 Ppa_Contig76
 643510
 643627
 +
ppc-mir-2242-2 MI0011211 765 Ppa_Contig76
 643780
 643897
 +
ppc-mir-2243 MI0011209 874 Ppa_Contig25
 354133
 354228
 +
ppc-mir-2244 MI0011166 1.64e+03 Ppa_Contig66
 112056
 112136
 -
ppc-mir-2245 MI0011212 1.09e+03 Ppa_Contig27
 40280
 40388
 +
ppc-mir-2246 MI0011214 655 Ppa_Contig31
 850994
 851093
 +
ppc-mir-2247 MI0011243 - Ppa_Contig0
 2933733
 2933825
 -
ppc-mir-2248 MI0011167 546 Ppa_Contig17
 167868
 167974
 -
ppc-mir-2249 MI0011215 2.29e+03 Ppa_Contig286
 18435
 18505
 +
ppc-mir-2250 MI0011219 1.09e+03 Ppa_Contig44
 128425
 128529
 +
ppc-mir-2251 MI0011225 - Ppa_Contig6
 1815940
 1816039
 +
ppc-mir-2252 MI0011160 1.75e+03 Ppa_Contig10
 574680
 574759
 -
ppc-mir-2253a MI0011168 437 Ppa_Contig26
 807060
 807123
 -
ppc-mir-2253b MI0011161 437 Ppa_Contig11
 438196
 438308
 -
ppc-mir-2254 MI0011169 - Ppa_Contig27
 814426
 814514
 -
ppc-mir-2255 MI0011172 874 Ppa_Contig103
 305549
 305634
 -
ppc-mir-2256 MI0011173 - Ppa_Contig103
 350655
 350768
 -
ppc-mir-2258 MI0011162 6.85e+04 Ppa_Contig11
 1411707
 1411817
 -
ppc-mir-2259 MI0011185 218 Ppa_Contig41
 860240
 860359
 -
ppc-mir-2260 MI0011186 1.42e+03
ppc-mir-2261 MI0011187 655 Ppa_Contig48
 224157
 224237
 -
ppc-mir-2262 MI0011188 218 Ppa_Contig5
 1065458
 1065570
 -
ppc-mir-2263 MI0011200 546 Ppa_Contig0
 2092943
 2093034
 +
ppc-mir-2264 MI0011201 3.39e+03 Ppa_Contig63
 301580
 301681
 +
ppc-mir-2265 MI0011203 546 Ppa_Contig2
 1443721
 1443810
 +
ppc-mir-2266 MI0011204 7.86e+03 Ppa_Contig2
 1443819
 1443918
 +
ppc-mir-2267 MI0011207 109 Ppa_Contig21
 468379
 468493
 +
ppc-mir-2268 MI0011227 3.28e+03 Ppa_Contig4
 1507377
 1507476
 -
ppc-mir-2269 MI0011229 218 Ppa_Contig45
 395912
 395987
 -
ppc-mir-2270 MI0011230 546 Ppa_Contig55
 699394
 699500
 -
ppc-mir-2271 MI0011231 2.51e+03 Ppa_Contig0
 2088561
 2088670
 +
ppc-mir-2272 MI0011234 1.42e+03 Ppa_Contig21
 467633
 467750
 +
ppc-mir-2273 MI0011235 - Ppa_Contig21
 467940
 468038
 +
ppc-mir-2274 MI0011241 2.73e+03 Ppa_Contig180
 297842
 297935
 +
Get selected sequences:
Select sequences and output type, then click "Fetch Sequences":