miRBase
Home
Search
Browse
Help
Download
Blog
Submit
Sus scrofa miRNAs (271 sequences)
ID
Accession
RPM
Chromosome
Start
End
Strand
Fetch
ssc-let-7a-1
MI0013085
-
9
47697398
47697477
-
ssc-let-7a-2
MI0017984
-
3
38549760
38549851
+
ssc-let-7c
MI0002445
-
13
130665021
130665114
+
ssc-let-7d
MI0022120
-
3
38552594
38552689
+
ssc-let-7e
MI0013086
-
6
39533375
39533454
+
ssc-let-7f-1
MI0002446
-
X
45720363
45720445
-
ssc-let-7f-2
MI0022121
-
3
38550127
38550223
+
ssc-let-7g
MI0013087
-
13
28999419
28999498
+
ssc-let-7i
MI0002447
-
5
26807364
26807448
+
ssc-mir-1
MI0010682
-
17
64096222
64096329
+
ssc-mir-7-1
MI0022122
-
1
200316395
200316478
-
ssc-mir-7-2
MI0002435
-
ssc-mir-9-1
MI0002462
-
4
4
97531326
97746791
97531414
97746879
+
-
ssc-mir-9-2
MI0002463
-
2
85597097
85597183
-
ssc-mir-9-3
MI0022123
-
7
60349131
60349211
+
ssc-mir-10a
MI0013101
-
12
22389424
22389503
-
ssc-mir-10b
MI0013102
-
15
77060704
77060783
+
ssc-mir-15a
MI0008211
-
11
17602978
17603056
+
ssc-mir-15b
MI0002419
-
13
78787511
78787608
+
ssc-mir-16-1
MI0008213
-
13
78787668
78787744
+
ssc-mir-16-2
MI0008212
-
11
17603121
17603199
+
ssc-mir-17
MI0008214
-
11
60972458
60972534
+
ssc-mir-18a
MI0002455
-
11
60972593
60972684
+
ssc-mir-18b
MI0017985
-
X
108212915
108212997
-
ssc-mir-19a
MI0002422
-
11
60972741
60972822
+
ssc-mir-19b-1
MI0013160
-
11
60973040
60973119
+
ssc-mir-19b-2
MI0013159
-
X
X
108178624
108212546
108178703
108212625
-
-
ssc-mir-20a
MI0002423
-
11
60972911
60972981
+
ssc-mir-20b-1
MI0022124
-
X
108178749
108178828
-
ssc-mir-20b-2
MI0022125
-
X
108212671
108212750
-
ssc-mir-21
MI0002459
-
12
34201565
34201656
+
ssc-mir-22
MI0014770
-
12
45319043
45319122
+
ssc-mir-23a
MI0002427
-
2
56861159
56861228
-
ssc-mir-23b
MI0013112
-
10
26149010
26149089
-
ssc-mir-24-1
MI0002428
-
2
56860821
56860892
-
ssc-mir-24-2
MI0013111
-
10
26148230
26148309
-
ssc-mir-26a
MI0002429
-
ssc-mir-27a
MI0002442
-
2
56860970
56861051
-
ssc-mir-27b
MI0013109
-
10
26148776
26148855
-
ssc-mir-28
MI0002430
-
13
95264193
95264278
-
ssc-mir-29a
MI0013090
-
18
16054752
16054837
+
ssc-mir-29b-1
MI0002431
-
18
16054349
16054429
+
ssc-mir-29b-2
MI0022126
-
9
127173767
127173850
+
ssc-mir-29c
MI0002460
-
9
127174326
127174413
+
ssc-mir-30a
MI0010688
-
1
53848998
53849104
-
ssc-mir-30b
MI0008215
-
4
5733584
5733659
+
ssc-mir-30c-1
MI0016618
-
6
121821241
121821320
-
ssc-mir-30c-2
MI0002461
-
1
53819906
53819985
-
ssc-mir-30d
MI0013091
-
4
5729459
5729537
+
ssc-mir-30e
MI0013092
-
6
121824301
121824380
-
ssc-mir-31
MI0022127
-
1
209939213
209939290
+
ssc-mir-32
MI0002443
-
ssc-mir-34a
MI0008216
-
ssc-mir-34c-1
MI0013132
-
9
38211158
38211237
+
ssc-mir-34c-2
MI0022128
-
9
38328138
38328211
+
ssc-mir-92a-1
MI0013125
-
11
60973160
60973239
+
ssc-mir-92a-2
MI0013124
-
X
X
108178486
108212408
108178565
108212487
-
-
ssc-mir-92b
MI0013126
-
4
98703325
98703404
-
ssc-mir-95
MI0002436
-
8
3350578
3350658
-
ssc-mir-98
MI0013122
-
X
45719499
45719578
-
ssc-mir-99a
MI0013114
-
13
130664295
130664374
+
ssc-mir-99b
MI0007077
-
6
39533216
39533285
+
ssc-mir-100
MI0013128
-
9
47702721
47702800
-
ssc-mir-101-1
MI0010678
-
1
227255282
227255372
-
ssc-mir-101-2
MI0010679
-
6
103818808
103818888
+
ssc-mir-103-1
MI0002448
-
16
52667657
52667738
-
ssc-mir-103-2
MI0013105
-
17
17
33406489
33574977
33406568
33575056
-
-
ssc-mir-105-1
MI0002410
-
X
121722373
121722453
+
ssc-mir-105-2
MI0002411
-
X
121720259
121720338
+
ssc-mir-106a
MI0002412
-
X
108213079
108213159
-
ssc-mir-107
MI0002449
-
14
106321702
106321788
-
ssc-mir-122
MI0002413
-
1
169284211
169284295
-
ssc-mir-124a-1
MI0010680
-
4
72452797
72452901
-
ssc-mir-124a-2
MI0002450
-
14
13279339
13279423
-
ssc-mir-125a
MI0013115
-
6
39533851
39533930
+
ssc-mir-125b-1
MI0013172
-
9
9
47573167
47654247
47573246
47654326
-
-
ssc-mir-125b-2
MI0002414
-
ssc-mir-126
MI0016619
-
1
294113069
294113141
+
ssc-mir-127
MI0013144
-
7
133929738
133929817
+
ssc-mir-128-1
MI0002451
-
15
14550874
14550955
-
ssc-mir-128-2
MI0013094
-
13
17766863
17766942
+
ssc-mir-129a
MI0013169
-
2
17100324
17100403
-
ssc-mir-129b
MI0017986
-
18
18269488
18269571
+
ssc-mir-130a
MI0008217
-
2
11301854
11301932
-
ssc-mir-130b
MI0013136
-
14
51318779
51318858
-
ssc-mir-132
MI0022129
-
12
45599483
45599560
-
ssc-mir-133a-1
MI0010681
-
17
64053943
64054045
-
ssc-mir-133a-2
MI0015909
-
ssc-mir-133b
MI0013089
-
7
53115236
53115315
+
ssc-mir-135-1
MI0002415
-
13
28964466
28964555
+
ssc-mir-135-2
MI0002416
-
5
81615635
81615734
-
ssc-mir-136
MI0002452
-
7
133834348
133834429
+
ssc-mir-137
MI0022130
-
4
124680215
124680296
-
ssc-mir-138
MI0022131
-
13
23336880
23336964
+
ssc-mir-139
MI0002453
-
9
6808359
6808426
-
ssc-mir-140
MI0002437
-
ssc-mir-142
MI0013134
-
12
32630403
32630482
-
ssc-mir-143
MI0013098
-
2
136030752
136030831
+
ssc-mir-144
MI0022132
-
12
42820916
42820991
-
ssc-mir-145
MI0002417
-
2
136032141
136032226
+
ssc-mir-146a
MI0015926
-
16
60604390
60604467
+
ssc-mir-146b
MI0010685
-
14
118471588
118471686
+
ssc-mir-148a
MI0002418
-
18
45214548
45214615
-
ssc-mir-148b
MI0013118
-
5
18088734
18088813
+
ssc-mir-149
MI0016620
-
15
131645452
131645527
-
ssc-mir-150-1
MI0022133
-
6
38211390
38211466
+
ssc-mir-150-2
MI0022134
-
6
38390200
38390276
-
ssc-mir-151
MI0013100
-
ssc-mir-152
MI0013104
-
12
21743215
21743294
+
ssc-mir-153
MI0002454
-
ssc-mir-155
MI0015907
-
13
135049633
135049713
-
ssc-mir-181a-1
MI0010686
-
10
22839352
22839455
-
ssc-mir-181a-2
MI0013106
-
1
280334006
280334085
+
ssc-mir-181b-1
MI0013107
-
10
22839191
22839270
-
ssc-mir-181b-2
MI0002420
-
1
280335868
280335953
+
ssc-mir-181c
MI0002438
-
2
56889316
56889402
+
ssc-mir-181d
MI0013108
-
2
56889500
56889579
+
ssc-mir-182
MI0022135
-
18
17167663
17167746
-
ssc-mir-183
MI0002439
-
18
17172238
17172307
-
ssc-mir-184
MI0002421
-
7
54379989
54380071
+
ssc-mir-185
MI0008218
-
14
52703712
52703787
+
ssc-mir-186
MI0002456
-
6
99703517
99703598
+
ssc-mir-187
MI0017987
-
6
83322553
83322630
-
ssc-mir-190a
MI0022136
-
1
112612942
112613023
-
ssc-mir-190b
MI0017988
-
4
99584645
99584727
+
ssc-mir-191
MI0013095
-
13
26605641
26605720
-
ssc-mir-192
MI0013127
-
2
5685412
5685491
+
ssc-mir-193a
MI0013113
-
12
41119432
41119511
-
ssc-mir-194a
MI0022137
-
2
5685211
5685286
+
ssc-mir-194b
MI0015905
-
10
9750913
9750990
-
ssc-mir-195
MI0013141
-
12
49575884
49575963
+
ssc-mir-196a-1
MI0022138
-
12
22434931
22435010
+
ssc-mir-196a-2
MI0002457
-
ssc-mir-196b-1
MI0013137
-
18
44179792
44179871
+
ssc-mir-196b-2
MI0022139
-
18
44205849
44205926
+
ssc-mir-199a-1
MI0016621
-
9
107644943
107645018
-
ssc-mir-199a-2
MI0013093
-
2
52684957
52685036
-
ssc-mir-199b
MI0008219
-
1
283325992
283326065
-
ssc-mir-202
MI0013157
-
14
147952465
147952544
-
ssc-mir-204
MI0002458
-
1
234511625
234511733
-
ssc-mir-205
MI0002440
-
9
126011588
126011656
-
ssc-mir-206
MI0013084
-
7
53111391
53111470
+
ssc-mir-208b
MI0013129
-
7
82144894
82144973
-
ssc-mir-210
MI0008220
-
2
331306
331381
+
ssc-mir-212
MI0022140
-
12
45599912
45599993
-
ssc-mir-214
MI0002441
-
9
107639153
107639262
-
ssc-mir-215
MI0010687
-
10
9750609
9750704
-
ssc-mir-216-1
MI0002424
-
3
79165852
79165956
+
ssc-mir-216-2
MI0022141
-
3
79385107
79385188
-
ssc-mir-217-1
MI0002425
-
3
79172584
79172690
+
ssc-mir-217-2
MI0022142
-
3
79378369
79378446
-
ssc-mir-218-1
MI0015924
-
8
11840694
11840777
+
ssc-mir-218-2
MI0022143
-
8
12027390
12027471
-
ssc-mir-218b
MI0017989
-
16
52396960
52397043
+
ssc-mir-219
MI0017990
-
7
29626556
29626638
+
ssc-mir-221
MI0008221
-
X
40478094
40478163
-
ssc-mir-222
MI0013151
-
X
40478834
40478913
-
ssc-mir-224
MI0002426
-
X
121480634
121480714
-
ssc-mir-296
MI0015906
-
17
61587158
61587234
-
ssc-mir-299
MI0014772
-
ssc-mir-301
MI0002432
-
ssc-mir-320
MI0013097
-
14
6473891
6473970
-
ssc-mir-323
MI0002433
-
ssc-mir-324
MI0013167
-
12
49872807
49872886
+
ssc-mir-325
MI0002444
-
X
X
60496392
60552421
60496485
60552514
+
-
ssc-mir-326
MI0002434
-
9
9132230
9132320
-
ssc-mir-328
MI0013158
-
6
13347429
13347508
+
ssc-mir-331
MI0013142
-
5
82983750
82983829
+
ssc-mir-335
MI0013165
-
18
16506711
16506790
-
ssc-mir-338
MI0014773
-
ssc-mir-339-1
MI0013149
-
3
406870
406949
+
ssc-mir-339-2
MI0022144
-
1
171250158
171250243
-
ssc-mir-340-1
MI0013110
-
2
67820612
67820691
+
ssc-mir-340-2
MI0022145
-
2
67919931
67920014
+
ssc-mir-342
MI0013153
-
7
130281629
130281708
-
ssc-mir-345-1
MI0013117
-
7
130435923
130436002
+
ssc-mir-345-2
MI0022146
-
7
130622837
130622914
-
ssc-mir-361
MI0013145
-
X
67904186
67904265
-
ssc-mir-362
MI0015913
-
ssc-mir-363-1
MI0014771
-
X
108178321
108178400
-
ssc-mir-363-2
MI0022147
-
X
108212240
108212324
-
ssc-mir-365-1
MI0013121
-
3
26344192
26344271
+
ssc-mir-365-2
MI0013120
-
12
41107186
41107265
-
ssc-mir-369
MI0014774
-
ssc-mir-370
MI0022148
-
7
133847437
133847516
+
ssc-mir-374a
MI0013130
-
X
58793654
58793733
-
ssc-mir-374b
MI0013131
-
X
58683650
58683729
+
ssc-mir-376a
MI0014775
-
ssc-mir-376b
MI0015916
-
ssc-mir-376c
MI0015915
-
ssc-mir-378-1
MI0013088
-
2
136265603
136265682
+
ssc-mir-378-2
MI0016622
-
12
35204198
35204265
-
ssc-mir-381
MI0015912
-
ssc-mir-382
MI0015911
-
ssc-mir-383
MI0015927
-
ssc-mir-411
MI0015908
-
ssc-mir-421
MI0015925
-
X
58683806
58683883
+
ssc-mir-423
MI0013099
-
12
44150500
44150579
+
ssc-mir-424
MI0013135
-
X
108499011
108499090
-
ssc-mir-425
MI0013133
-
13
26605151
26605230
-
ssc-mir-429
MI0017991
-
6
42894049
42894129
-
ssc-mir-432
MI0013155
-
7
133834157
133834236
+
ssc-mir-450a
MI0010683
-
X
108480688
108480793
-
ssc-mir-450b
MI0013140
-
X
108480529
108480608
-
ssc-mir-450c
MI0014776
-
X
108480833
108480913
-
ssc-mir-451
MI0016623
-
12
42820766
42820830
-
ssc-mir-452
MI0022149
-
X
121481687
121481766
-
ssc-mir-455
MI0013170
-
1
267848307
267848386
+
ssc-mir-484
MI0015929
-
ssc-mir-486-1
MI0013103
-
17
10558722
10558801
+
ssc-mir-486-2
MI0017992
-
17
10710557
10710638
+
ssc-mir-487b
MI0015928
-
ssc-mir-489
MI0022150
-
9
68616062
68616142
-
ssc-mir-490-1
MI0015914
-
18
10924562
10924640
+
ssc-mir-490-2
MI0022151
-
18
10994299
10994379
-
ssc-mir-491
MI0017993
-
1
210973878
210973953
-
ssc-mir-493
MI0022152
-
7
133858663
133858745
-
ssc-mir-494
MI0015934
-
ssc-mir-497
MI0013139
-
12
49575594
49575673
+
ssc-mir-499
MI0013096
-
17
40405262
40405341
-
ssc-mir-500
MI0013166
-
ssc-mir-503
MI0010684
-
X
108498665
108498773
-
ssc-mir-504
MI0013143
-
X
111416461
111416540
+
ssc-mir-505
MI0013171
-
X
112590812
112590891
+
ssc-mir-532
MI0013150
-
ssc-mir-542
MI0013138
-
X
108481539
108481618
-
ssc-mir-545
MI0017994
-
X
58793489
58793567
-
ssc-mir-551a
MI0022153
-
6
43640514
43640593
-
ssc-mir-574
MI0013161
-
8
25753375
25753454
+
ssc-mir-582
MI0022154
-
16
36589528
36589604
+
ssc-mir-615
MI0017995
-
5
17933488
17933575
-
ssc-mir-628
MI0013163
-
1
121208279
121208358
+
ssc-mir-652
MI0015919
-
ssc-mir-664
MI0013123
-
10
9823258
9823337
-
ssc-mir-671
MI0022155
-
18
5054307
5054386
-
ssc-mir-676-1
MI0013152
-
X
55113034
55113113
-
ssc-mir-676-2
MI0022156
-
X
55165141
55165216
-
ssc-mir-708
MI0013154
-
9
13711347
13711426
-
ssc-mir-744
MI0014769
-
7
12
108483610
53485953
108483689
53486032
+
+
ssc-mir-758
MI0014777
-
ssc-mir-769
MI0013168
-
6
36259104
36259183
-
ssc-mir-874
MI0022157
-
2
126729109
126729192
-
ssc-mir-885
MI0013119
-
13
55826401
55826480
-
ssc-mir-935
MI0013156
-
6
6
40293236
40351581
40293315
40351660
+
+
ssc-mir-1224
MI0015920
-
ssc-mir-1249-1
MI0022158
-
5
875650
875731
-
ssc-mir-1249-2
MI0022159
-
5
927602
927683
+
ssc-mir-1271
MI0015922
-
ssc-mir-1277
MI0013146
-
X
97562457
97562536
-
ssc-mir-1285
MI0013164
-
1
1
187873108
188101720
187873187
188101799
+
-
ssc-mir-1296
MI0015931
-
14
69493248
69493332
-
ssc-mir-1306
MI0013148
-
14
52728146
52728225
+
ssc-mir-1307
MI0013147
-
14
119440203
119440282
-
ssc-mir-1343
MI0017996
-
2
24490869
24490947
-
ssc-mir-1468
MI0022160
-
X
50243073
50243155
+
ssc-mir-1839
MI0013162
-
7
58239591
58239670
-
ssc-mir-2320
MI0017997
-
6
43886635
43886715
-
ssc-mir-2366-1
MI0022162
-
1
134001040
134001122
-
ssc-mir-2366-2
MI0022163
-
1
134062647
134062729
+
ssc-mir-2411
MI0022164
-
4
99530696
99530778
-
ssc-mir-2483
MI0022167
-
X
100547917
100547992
-
ssc-mir-3613
MI0022161
-
11
17653863
17653939
+
ssc-mir-4331
MI0015910
-
6
43795786
43795865
+
ssc-mir-4332
MI0015917
-
ssc-mir-4333
MI0015918
-
5
80804447
80804559
-
ssc-mir-4334
MI0015921
-
15
114394216
114394284
+
ssc-mir-4335
MI0015923
-
9
9634262
9634325
+
ssc-mir-4336
MI0015930
-
9
26389442
26389529
+
ssc-mir-4337
MI0015932
-
18
13426657
13426734
-
ssc-mir-4338
MI0015933
-
ssc-mir-4339
MI0015935
-
Get selected sequences:
Stem-loop sequence
Mature sequence
Select sequences and output type, then click "Fetch Sequences":
Unaligned fasta format
ClustalW alignment