miRBase
Home
Search
Browse
Help
Download
Blog
Submit
Tribolium castaneum miRNAs (220 sequences)
ID
Accession
RPM
Chromosome
Start
End
Strand
Fetch
tca-bantam
MI0010584
2.15e+04
chrLG3
21818954
21819034
-
tca-let-7
MI0008896
1.35e+03
chrLG6
6881406
6881483
+
tca-mir-1
MI0008892
1.81e+04
chrLG5
12993495
12993566
-
tca-mir-2a
MI0008894
7.92e+04
chrLG3
561179
561266
+
tca-mir-2b
MI0008895
8.12e+04
chrLG3
561332
561416
+
tca-mir-2c
MI0008893
8e+04
chrLG3
560814
560896
+
tca-mir-7
MI0008897
5.94e+03
chrLG7
2378804
2378881
+
tca-mir-8
MI0008898
3.58e+04
chrLG9
12695002
12695074
-
tca-mir-9a
MI0010583
3.29e+03
chrLG1
6597003
6597083
+
tca-mir-9b
MI0008935
865
tca-mir-9c
MI0016304
7.83e+03
chrLG3
19008388
19008494
+
tca-mir-9d
MI0016321
986
chrLG5
9014390
9014482
+
tca-mir-9e
MI0020231
-
tca-mir-10
MI0008899
7.37e+03
chrLG2
10271871
10271941
+
tca-mir-11
MI0016375
1.47e+03
tca-mir-12
MI0008900
8.18e+03
chrLG3
24360466
24360552
-
tca-mir-13a
MI0008901
7.36e+03
chrLG3
560937
561016
+
tca-mir-13b
MI0008902
1.47e+04
chrLG3
561053
561126
+
tca-mir-14
MI0008903
8.88e+04
chrLG3
3935190
3935276
+
tca-mir-29
MI0016349
1.21e+03
chrLG9
4694287
4694416
+
tca-mir-31
MI0008904
4.99e+03
chrLG7
7967712
7967788
+
tca-mir-33
MI0008905
199
chrLG4
9369324
9369425
-
tca-mir-34
MI0008906
6.25e+03
chrLG7
17775029
17775107
-
tca-mir-71
MI0008907
8.17e+03
chrLG3
560700
560778
+
tca-mir-87a
MI0008908
4.03e+04
chrLG6
2549047
2549128
+
tca-mir-87b
MI0016332
4.03e+04
chrLG6
2551905
2552002
+
tca-mir-92a
MI0008909
2.55e+03
chrLG8
2996277
2996354
+
tca-mir-92b
MI0008910
6.08e+03
chrLG8
2996827
2996908
+
tca-mir-92c
MI0016341
1.2e+03
chrLG7
2339811
2339938
+
tca-mir-100
MI0008911
1.61e+04
chrLG6
6881272
6881347
+
tca-mir-124
MI0008912
5.76e+04
chrLG5
17227056
17227134
-
tca-mir-125
MI0008913
1.16e+04
chrLG6
6881595
6881671
+
tca-mir-133
MI0008914
7.1e+03
chrLG5
12967046
12967129
-
tca-mir-137
MI0008915
469
chrLG7
5152251
5152327
+
tca-mir-184
MI0008916
6.44e+03
chrLG7
12912843
12912921
-
tca-mir-190
MI0008917
742
chrLG7
1057992
1058077
-
tca-mir-193
MI0016396
201
chrLG8
5773126
5773222
-
tca-mir-210
MI0008918
2.7e+03
chrLG4
8182051
8182126
-
tca-mir-219
MI0008919
29.1
chrLG3
7583060
7583137
+
tca-mir-252a
MI0016350
5.64e+03
chrLG9
10101246
10101332
+
tca-mir-252b
MI0016351
66.7
chrLG9
10093331
10093424
+
tca-mir-263a
MI0010586
6.24e+03
chrLG5
16993036
16993126
-
tca-mir-263b
MI0008920
1.32e+03
chrLG3
6781530
6781604
+
tca-mir-275
MI0008921
540
chrLG9
15544836
15544906
-
tca-mir-276
MI0008922
4.22e+04
chrLG3
15558737
15558807
-
tca-mir-277
MI0008923
7.83e+03
chrLG7
17779702
17779782
-
tca-mir-279a
MI0008924
4.62e+04
chrLG7
11386894
11386958
-
tca-mir-279b
MI0010587
8.63e+04
chrLG5
411407
411498
-
tca-mir-279c
MI0016312
2.82e+04
chrLG3
19008637
19008748
+
tca-mir-279d
MI0016342
1.54e+04
chrLG7
11386723
11386864
-
tca-mir-279e
MI0016356
3.05e+04
chrLG9
11200
11294
-
tca-mir-281
MI0008925
2.1e+04
chrLG7
1799827
1799893
-
tca-mir-282
MI0008926
523
chrLG7
13175270
13175342
+
tca-mir-283
MI0008927
406
chrLG3
24364871
24364946
-
tca-mir-304
MI0010593
8.89
chrLG5
12760582
12760674
-
tca-mir-305
MI0008928
1.61e+04
chrLG9
15544697
15544771
-
tca-mir-307
MI0008929
3.76e+04
chrLG8
16997084
16997151
+
tca-mir-308
MI0016300
4.94e+03
chrLG2
5948803
5948905
-
tca-mir-309a
MI0016322
1.14e+04
chrLG5
9014623
9014710
+
tca-mir-309b
MI0016391
4.83e+03
chrLG5
9016116
9016205
+
tca-mir-315
MI0010590
24
chrLG1
1751215
1751293
+
tca-mir-316
MI0016305
4.11e+03
chrLG3
998890
998978
+
tca-mir-317
MI0008930
2.93e+04
chrLG7
17787946
17788022
-
tca-mir-375
MI0016345
906
chrLG8
17119006
17119079
-
tca-mir-750
MI0016358
3.46e+04
chrLG4
10504114
10504205
+
tca-mir-927a
MI0008931
202
chrLG9
16488286
16488353
+
tca-mir-927b
MI0020230
-
chrLG9
16099288
16099383
-
tca-mir-929
MI0008934
92.2
chrLG9
12108517
12108619
-
tca-mir-932
MI0008932
551
chrLG5
17549444
17549527
-
tca-mir-965
MI0010589
456
chrLG5
10174230
10174333
+
tca-mir-970
MI0010585
2.35e+03
chrLG2
13567562
13567652
+
tca-mir-980
MI0016380
2.32e+03
tca-mir-981
MI0010592
14.6
chrLG4
4507674
4507769
+
tca-mir-989
MI0016359
895
chrLG4
193538
193629
+
tca-mir-993
MI0010588
6.72e+03
chrLG2
10310879
10310966
-
tca-mir-995
MI0016260
8.2e+03
chrLG10
8777585
8777678
-
tca-mir-998
MI0016374
3.51e+03
tca-mir-1000
MI0010591
1.42e+03
chrLG2
2216657
2216756
+
tca-mir-1175
MI0016357
1.08e+04
chrLG4
10504260
10504364
+
tca-mir-2765
MI0016261
916
chrLG10
6316947
6317072
-
tca-mir-2788
MI0016347
451
chrLG8
5772996
5773091
-
tca-mir-2796
MI0016303
903
chrLG2
19363957
19364114
-
tca-mir-2944a
MI0016306
3.73e+03
chrLG3
19008516
19008604
+
tca-mir-2944b
MI0016320
802
chrLG5
9014499
9014600
+
tca-mir-2944c
MI0016353
4.54e+03
chrLG9
10955
11064
-
tca-mir-3049
MI0016336
255
chrLG6
7794827
7794997
-
tca-mir-3477
MI0016315
578
chrLG3
24360683
24360783
-
tca-mir-3791
MI0016389
1.75e+03
chrLG5
9016217
9016301
+
tca-mir-3802
MI0016256
70.6
chrLG10
10292984
10293102
+
tca-mir-3803
MI0016257
44.3
chrLG10
2280351
2280435
+
tca-mir-3804a
MI0016258
85.5
chrLG10
7547882
7547960
-
tca-mir-3804b
MI0016259
156
chrLG10
7551723
7551823
-
tca-mir-3805a
MI0016262
155
chrLG1
8500013
8500108
+
tca-mir-3805b
MI0016278
93.1
chrLG1
8499375
8499478
+
tca-mir-3806
MI0016263
665
chrLG1
8499798
8499943
+
tca-mir-3807
MI0016264
7.48e+03
chrLG1
8494849
8494947
+
tca-mir-3808
MI0016265
147
chrLG1
8497132
8497243
+
tca-mir-3809
MI0016266
979
chrLG1
8487138
8487230
+
tca-mir-3810
MI0016267
65
chrLG1
8492765
8492866
+
tca-mir-3811a
MI0016289
289
chrLG1
8497719
8497815
+
tca-mir-3811b
MI0016285
293
chrLG1
8498053
8498138
+
tca-mir-3811c-1
MI0016268
592
chrLG1
8498375
8498471
+
tca-mir-3811c-2
MI0016276
592
chrLG1
8498710
8498806
+
tca-mir-3811d
MI0016271
318
chrLG1
8499035
8499138
+
tca-mir-3811e
MI0016279
90.3
chrLG1
8499605
8499716
+
tca-mir-3812
MI0016269
663
chrLG1
8496077
8496196
+
tca-mir-3813
MI0016270
280
chrLG1
8488676
8488768
+
tca-mir-3814
MI0016272
88.4
chrLG1
8489232
8489323
+
tca-mir-3815
MI0016273
129
chrLG1
8495199
8495293
+
tca-mir-3816
MI0016274
909
chrLG1
8496207
8496378
+
tca-mir-3817
MI0016275
657
chrLG1
8496709
8496824
+
tca-mir-3818
MI0016277
249
chrLG1
8487911
8488003
+
tca-mir-3819
MI0016406
150
chrLG4
12479899
12480009
+
tca-mir-3820
MI0016280
421
chrLG1
8488902
8488994
+
tca-mir-3821
MI0016281
66.5
chrLG1
8487592
8487683
+
tca-mir-3822
MI0016282
99
chrLG1
8495616
8495778
+
tca-mir-3823
MI0016283
10.8
chrLG1
8501770
8501860
+
tca-mir-3824
MI0016284
167
chrLG1
8501573
8501669
+
tca-mir-3825
MI0016286
180
chrLG1
8487284
8487378
+
tca-mir-3826
MI0016287
176
chrLG1
8496423
8496535
+
tca-mir-3827
MI0016288
757
chrLG1
6968279
6968353
+
tca-mir-3828
MI0016290
368
chrLG1
8496935
8497035
+
tca-mir-3829
MI0016291
568
chrLG1
8494396
8494485
+
tca-mir-3830
MI0016292
513
chrLG1
6575627
6575705
-
tca-mir-3831
MI0016293
12.6
chrLG1
10437823
10437913
-
tca-mir-3832
MI0016294
17.3
chrLG1
4540835
4540935
-
tca-mir-3833
MI0016295
33
chrLG2
5029191
5029280
+
tca-mir-3834
MI0016297
2.11e+03
chrLG2
2869168
2869231
+
tca-mir-3835
MI0016298
11.1
chrLG2
3085133
3085220
+
tca-mir-3836a
MI0016299
502
chrLG2
1663485
1663575
+
tca-mir-3836b
MI0016302
601
chrLG2
3560286
3560376
-
tca-mir-3837
MI0016301
6.71
chrLG2
3697871
3697979
-
tca-mir-3838
MI0016307
14.9
chrLG3
18866604
18866744
+
tca-mir-3839
MI0016308
22.4
chrLG3
8097166
8097267
+
tca-mir-3840
MI0016309
566
chrLG3
19008275
19008365
+
tca-mir-3841
MI0016310
973
chrLG3
19008152
19008246
+
tca-mir-3842
MI0016311
13.1
chrLG3
559271
559366
+
tca-mir-3843
MI0016313
270
tca-mir-3844
MI0016314
305
chrLG3
7968077
7968163
-
tca-mir-3845
MI0016316
1.38e+03
chrLG3
20626752
20626898
-
tca-mir-3846
MI0016317
89.4
chrLG3
19764596
19764726
-
tca-mir-3847
MI0016318
12.6
chrLG3
1915336
1915432
-
tca-mir-3848
MI0016319
122
chrLG3
9556447
9556531
-
tca-mir-3849
MI0016323
153
chrLG5
6923854
6923950
+
tca-mir-3850
MI0016324
92.1
chrLG5
18531941
18532096
-
tca-mir-3851a-1
MI0016326
3.15e+03
chrLG5
349900
350007
-
tca-mir-3851a-2
MI0016330
3.16e+03
chrLG5
22919
23026
-
tca-mir-3851b
MI0016325
2.73e+03
chrLG5
349503
349610
-
tca-mir-3851c
MI0016334
3.4e+03
chrLG6
12644153
12644263
+
tca-mir-3851d
MI0016337
3.38e+03
chrLG6
12637928
12638099
-
tca-mir-3851e
MI0016338
3.24e+03
chrLG6
12748781
12748875
-
tca-mir-3851f
MI0016340
3.37e+03
chrLG6
12747709
12747803
-
tca-mir-3852
MI0016327
45.9
chrLG5
19005906
19005999
-
tca-mir-3853
MI0016328
27.6
chrLG5
7361236
7361350
-
tca-mir-3854
MI0016329
121
chrLG5
3446627
3446696
-
tca-mir-3855
MI0016331
144
chrLG6
12571558
12571629
+
tca-mir-3856
MI0016333
11.1
chrLG6
4494291
4494373
+
tca-mir-3857
MI0016335
20.6
chrLG6
11700191
11700293
+
tca-mir-3858
MI0016339
369
chrLG6
12747514
12747582
-
tca-mir-3859
MI0016343
45.6
chrLG7
15993646
15993714
-
tca-mir-3860
MI0016344
28.3
chrLG7
1766078
1766143
-
tca-mir-3861
MI0016346
62.1
chrLG8
5491726
5491833
-
tca-mir-3862
MI0016348
1.77e+03
chrLG9
18989340
18989429
+
tca-mir-3863
MI0016352
316
chrLG9
18989446
18989538
+
tca-mir-3864
MI0016354
53.1
chrLG9
13288009
13288087
-
tca-mir-3865
MI0016355
21.9
chrLG9
19985376
19985475
-
tca-mir-3866
MI0016360
22.2
chrLG4
989642
989730
-
tca-mir-3867
MI0016361
68.8
chrLG3
1515754
1515845
+
tca-mir-3868
MI0016362
16.8
chrLG3
25943225
25943331
-
tca-mir-3869
MI0016363
5.88e+03
chrLG5
18531393
18531464
+
tca-mir-3870
MI0016364
11.3
chrLG5
12805208
12805287
-
tca-mir-3871
MI0016365
36.6
chrLG7
2957127
2957203
+
tca-mir-3872
MI0016366
24.5
chrLG7
16984113
16984205
-
tca-mir-3873
MI0016367
267
chrLG7
6260946
6261068
-
tca-mir-3874
MI0016368
98.4
chrLG8
3911255
3911396
-
tca-mir-3875
MI0016369
10.3
chrLG8
10042473
10042546
-
tca-mir-3876
MI0016370
5.16
chrLG9
8557821
8557881
+
tca-mir-3877
MI0016371
57.5
chrLG9
15917037
15917104
-
tca-mir-3878
MI0016372
5.67
chrLG4
8227919
8228007
+
tca-mir-3879
MI0016373
245
chrLG4
5003821
5003889
-
tca-mir-3880
MI0016376
383
tca-mir-3881
MI0016377
86.1
tca-mir-3882
MI0016378
1.45e+03
tca-mir-3883
MI0016379
17.5
tca-mir-3884
MI0016381
92.8
tca-mir-3885
MI0016382
105
chrLG10
9496780
9496871
-
tca-mir-3886
MI0016383
256
chrLG1
5559656
5559739
+
tca-mir-3887
MI0016384
337
chrLG1
9216534
9216615
-
tca-mir-3888
MI0016385
154
chrLG2
14919997
14920117
+
tca-mir-3889
MI0016386
2.82e+03
chrLG3
19008017
19008112
+
tca-mir-3890
MI0016387
111
chrLG3
21939341
21939478
-
tca-mir-3891
MI0016388
121
chrLG3
4796598
4796689
-
tca-mir-3892
MI0016390
556
chrLG5
19019682
19019756
+
tca-mir-3893
MI0016392
342
chrLG5
9015904
9015983
+
tca-mir-3894
MI0016393
171
chrLG7
13560815
13560901
-
tca-mir-3895
MI0016394
288
chrLG8
7120099
7120188
+
tca-mir-3896
MI0016395
111
chrLG8
5838035
5838138
+
tca-mir-3897
MI0016397
139
chrLG4
854681
854762
-
tca-mir-3898
MI0016398
205
chrLG2
5676904
5677002
+
tca-mir-3899
MI0016399
95.3
chrLG3
9042128
9042187
+
tca-mir-3900
MI0016400
94.8
chrLG3
26787773
26787843
-
tca-mir-3901
MI0016401
342
chrLG9
17576876
17577005
-
tca-mir-3902
MI0016402
750
chrLG10
5247379
5247481
+
tca-mir-3903
MI0016403
214
chrLG1
10618010
10618097
+
tca-mir-3904
MI0016404
103
chrLG3
26558002
26558122
-
tca-mir-3905
MI0016405
512
chrLG9
16190463
16190586
-
tca-mir-6007
MI0020218
-
chrLG1
8492377
8492463
+
tca-mir-6008
MI0020219
-
chrLG2
14782252
14782347
+
tca-mir-6009
MI0020220
-
chrLG2
186871
186960
+
tca-mir-6010
MI0020221
-
chrLG2
11831158
11831242
+
tca-mir-6011
MI0020222
-
chrLG3
31219647
31219723
-
tca-mir-6012
MI0020223
-
chrLG3
9600253
9600425
-
tca-mir-6013
MI0020224
-
chrLG4
11124335
11124402
+
tca-mir-6014
MI0020225
-
chrLG4
3369897
3369978
+
tca-mir-6015
MI0020226
-
chrLG4
11485945
11486036
+
tca-mir-6016
MI0020227
-
chrLG7
17010368
17010442
-
tca-mir-6017
MI0020228
-
chrLG7
10450348
10450502
-
tca-mir-6018
MI0020229
-
chrLG8
247709
247801
-
tca-mir-iab-4
MI0008933
2.11e+04
chrLG2
9783811
9783891
-
tca-mir-iab-8
MI0016296
5.35e+03
chrLG2
9783805
9783898
+
Get selected sequences:
Stem-loop sequence
Mature sequence
Select sequences and output type, then click "Fetch Sequences":
Unaligned fasta format
ClustalW alignment