Accession
MI0027509
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR159 precursor miRNA
Gene family
MIPF0000010;
MIR159
Sequence
107964
reads,
56183
reads per million, 4 experiments
uucuaugaguuguuuagauuguuggguuguguguauuuuuguaggguuguugacauggagcuccuugagguccaauccagguucuuacuuagguaaaagcagcugcuaguucauggaucccacuguguuauuuccaaauauaagagaauggagauauaauggugguuugcaugaccaaggagcugcauucuugccuugugagauuccuugUUUGGAUUGAAGGGAGCUCUAuguguucuccccuuccaagcuuauuuucucucucauuuauuuagcccuugaucuuuucauuuuuugaa
.((...(((.((...((((((..((((((.(((((..((((.((((..(...((((((((((((((..(((((((.(.(((.((((((..((((((((((((((.((.(.(((((.(..(((((((..((((((((............))))))))..)))))))..).))))).).)).)))))).)).)))))).))))))..))).).)))))))..))))))))))))))...)..))))..))))..)))..............)).)))))).))))))...)).)))..)).
.((...(((.((...((((((..((((((.(((((..((((.((((..(...((((((((((((((..(((((((.(.(((.((((((..((((((((((((((.((.(.(((((.(..(((((((..((((((((............))))))))..)))))))..).))))).).)).)))))).)).)))))).))))))..))).).)))))))..))))))))))))))...)..))))..))))..)))..............)).)))))).))))))...)).)))..)).
Structure
u uau u uuu uu u -------------- uu -u uu uug ga u c -u uu - - g a u g uc gu aauau uc gag ug agauug ggguug gu gua uuug aggg g acauggagcuccuu gguccaa c agg ucuuac agguaa aa gcagcu cu g ucaug a ccacugu uauuucca a || ||| || |||||| |||||| || ||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||| |||||| || |||||| || | ||||| | ||||||| |||||||| ag uuu ac ucuagu cccgau ua uau gaac uccc c uguAUCUCGAGGGA UUAGGUU g ucc agagug uccguu uu cgucga ga c aguac u gguggua auagaggu a a -uu u uuu -u u uuuacucucucuuu uc cu cu uug AG U u uu -u c a g a c g uu au aagag
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00105: 1236832-1237130 [-]
Database links
Mature atr-miR159
| Accession | MIMAT0033911 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR159 mature miRNA |
| Sequence | 211 - UUUGGAUUGAAGGGAGCUCUA - 231 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
