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miRBase |
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Stem-loop sequence osa-MIR2118k |
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Accession | MI0011261 (change log) | |||||||||||||||||||||||||||||
Description | Oryza sativa miR2118k stem-loop | |||||||||||||||||||||||||||||
Gene family | MIPF0000745; MIR2118 | |||||||||||||||||||||||||||||
Literature search |
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28 open access papers mention osa-MIR2118k | |||||||||||||||||||||||||||||
Stem-loop |
--- aaaga c u -c ga -cu cuauug - g 5' gcaagcca ggaagaggaag gaguaucu agaau gugggaaugaga cau aggaaagc aagcu ucc ccucua u |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||| 3' cguucggu ccuucuccuuc cucgugga ucuug uauccuuacucu gua uccuuuug uuuga agg ggaggu a uuu ----- u u cc -g uac -uucaa u u |
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Deep sequencing |
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Confidence |
Annotation confidence: not enough data
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Genome context |
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Clustered miRNAs |
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Database links |
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Mature sequence osa-miR2118k |
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Accession | MIMAT0011750 |
Sequence |
118 - uuccugaugccucucauuccua - 139 |
Evidence | experimental; 454 [1] |
References |
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1 |
PMID:19584097
"Clusters and superclusters of phased small RNAs in the developing inflorescence of rice"
Genome Res. 19:1429-1440(2009).
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