Accession
MI0001766
Description
Saccharum officinarum
sof-MIR408b precursor miRNA
Gene family
MIPF0000102;
MIR408
Literature search
9 open access papers mention sof-MIR408b
(90 sentences)
(90 sentences)
Sequence
agaagauggguaugguuggagacagggaugaggcagagcaugggauggggccaucaacaaaauuuccaauuucuguccuccgcuaggccgcuacugcauuuauguuugcuugcucacaaaacggagggauuugugagaguuaucaggcagaaagaacaaagaaggugccucccuggugaaguggugauggccugaccugagagggcugagagcucagcugguguccugguguuguugcuuccucccCUGCACUGCCUCUUCCCUGGCuccccaccguugcccuugc
.......(((((((((.((((.((((((.(((((((.(((.((((.(((((((((((((..........((((.((((((((.(((((((.((((((.(((((.((((((((((((((((.(.....).))))))))......))))))))...........(((......))).))))))))))).)))))))...)).)))))).))))..........)))..))))).....))))).)))).))).))))))).)))))).))))..)))).)))))....
.......(((((((((.((((.((((((.(((((((.(((.((((.(((((((((((((..........((((.((((((((.(((((((.((((((.(((((.((((((((((((((((.(.....).))))))))......))))))))...........(((......))).))))))))))).)))))))...)).)))))).))))..........)))..))))).....))))).)))).))).))))))).)))))).))))..)))).)))))....
Structure
agaagau - -u a u a u u ----- -- aaauuuccaa u - --c c a -----------------------g ------ a g
gggua uggu ggag caggga gaggcag gca ggga ggggc cauca aca uuuc guccuc cg uaggccg uacugc uuuau uuugcuug cucacaaa c g
||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| |||| |||||| || ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| | a
cccgu gcca ccuC GUCCCU CUCCGUC CGU cccu cuucg guggu ugu agag cgggag gu guccggu guggug aagug agacggac gaguguuu g g
---cguu u cc G U A C c uuguu cc ggucgacucg u a cca a - gucccuccguggaagaaacaagaa uauuga a g
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
Unknown
Database links
Mature sof-miR408b
| Accession | MIMAT0001668 |
| Description | Saccharum officinarum sof-miR408b mature miRNA |
| Sequence | 247 - CUGCACUGCCUCUUCCCUGGC - 267 |
| Evidence | not_experimental |
References
|
