Accession
MI0001752
Description
Medicago truncatula
mtr-MIR156a precursor miRNA
Literature search
10 open access papers mention mtr-MIR156a
(77 sentences)
(77 sentences)
Sequence
agccaugaaucaguccgagaUGACAGAAGAGAGAGAGCACAcccaccugauuacaaguaacaaaaaacuaccaacuaucaacauuuugucuacuaugaagaaaaucacaugucuagacuauaguuacgaauggaagauacauucaaugauguuuaugaaaauuugagacggucgaggacuauaguuacucuaucgcauacauuuaaugacaaaaaaaauuguguacucuuauuuauuuucaauacaucuucauucaauuucuaugcaagaaucaaaaugcaguauaaaaaauugcauucaauaucaugguaaaaaaauuguucaaaaaaaguaaauaucaugguaaaaaaaucauuagauuuugcaauaaguaagagucaaguuuuaccuugugaggaauuccucccaacagaaucaugggagcucuuucuucuucucucauugugcccugccagucucc
..........(((..((.(((((.((((((((((((((...((((..(((((...(((........)))......(((.((((((..(((((.((((..........))))..))))).........(((((.......)))))...)))))).)))(((((((((..((((.((((((....))).))).)))).(((((..................))))).((((((((((((.........(((((((.........))).)))).....((((((((.......))))))))...((((((((((........................))))))))))..((((((....))))))..)))))))))))))))))))))...(((.((((....)))).)))...))))))))).)))))))).)))))).))))).))..))).........
..........(((..((.(((((.((((((((((((((...((((..(((((...(((........)))......(((.((((((..(((((.((((..........))))..))))).........(((((.......)))))...)))))).)))(((((((((..((((.((((((....))).))).)))).(((((..................))))).((((((((((((.........(((((((.........))).)))).....((((((((.......))))))))...((((((((((........................))))))))))..((((((....))))))..)))))))))))))))))))))...(((.((((....)))).)))...))))))))).)))))))).)))))).))))).))..))).........
Structure
agccaugaau uc a C - ACA cc acaaguaacaaaaaacuaccaacuaucaacauuuugucuacuaugaagaaaaucacaugucuagacuauaguuacgaauggaagauacauucaaugauguuuaug gacggucgaggacuauaguuacucuaucgcauacauuuaaugacaaaaaaaauugugua uucaauacaucuucauucaauuucuaugcaagaaucaaaaugcaguauaaaaaauugcauuca
cag cg gaUGA AGAAGA GAGAGAGC ccca ugauu aaaauuuga cucuuauuuauu a
||| || ||||| |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||
guc gu uuacu ucuucu cuuucucg gggu acuaa uuuugaacu gagaaugaauaa u
-ccucugacc cc g c u --a -- -------------------------------------------------------------------------------gacaacccuccuuaaggaguguucca ----------------------------------------------------------- cguuuuagauuacuaaaaaaaugguacuauaaaugaaaaaaacuuguuaaaaaaaugguacua
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
contig_50145: 402-861 [-]
Database links
Mature mtr-miR156a
| Accession | MIMAT0001654 |
| Description | Medicago truncatula mtr-miR156a mature miRNA |
| Sequence | 21 - UGACAGAAGAGAGAGAGCACA - 41 |
| Evidence |
experimental
454 [2], Northern [2] |
References
|
