Accession
MI0006035
Description
Physcomitrella patens
ppt-MIR1069 precursor miRNA
Sequence
uguucuucaagcacauguccacuucauguUCUCAAGUCUUAUCAUUGGAUugagcaccuuggucuuucaaauauucuauuaugauauguugauauauaauuggucuuucaaguauuuucucauuaauaugaaaacauauuauuacaaaauauuuuugcauauuauuguaguauacuUGAUAAAUCAAAGUGCUCACUguaaugauaaagcuugagaacaugaagucuacuugacuucuacuuug
.............((.((..(((((((((((((((((.(((((((((.(.(((((((.(((((...((((.(((.((((.(((((((((.((((((((((..((.(((((..((((........)))))))))))..)))))......)))))...))))))))).)))).))).))))...))))).))))))).).))))))))).)))))))))))))))))..)).))............
.............((.((..(((((((((((((((((.(((((((((.(.(((((((.(((((...((((.(((.((((.(((((((((.((((((((((..((.(((((..((((........)))))))))))..)))))......)))))...))))))))).)))).))).))))...))))).))))))).).))))))))).)))))))))))))))))..)).))............
Structure
uguucuucaagca u cc C G U c cuu a u u --u ------ ug c ag uuc
ca gu acuucauguUCUCAAGU UUAUCAUUG A ugagcac uuggu ucaa uau cuau augauaugu gauau auaau gu uuuca uauu u
|| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||
gu ca ugaaguacaagaguucg aauaguaau U ACUCGUG AACUA AGUu aua gaug uauuauacg uuaua uauua ca aaagu auaa c
-guuucaucuuca u uc a g C A AAU c u u uuu aaacau ua - -- uua
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
Chr05: 706260-706503 [+]
Database links
Mature ppt-miR1069-5p
| Accession | MIMAT0005196 |
| Description | Physcomitrella patens ppt-miR1069-5p mature miRNA |
| Sequence | 30 - UCUCAAGUCUUAUCAUUGGAU - 50 |
| Evidence |
experimental
454 [1] |
Mature ppt-miR1069-3p
| Accession | MIMAT0005197 |
| Description | Physcomitrella patens ppt-miR1069-3p mature miRNA |
| Sequence | 177 - UGAUAAAUCAAAGUGCUCACU - 197 |
| Evidence |
experimental
454 [1] |
References
|
