Accession
MI0006064
Description
Selaginella moellendorffii
smo-MIR1081 precursor miRNA
Sequence
ucuuuugugaggcuugccuuugauucucugagcucugggaggugugauucccucaccuccuagcucugagaaucaacagcaagccucacacacaucggcuguucuuugaucucgucuugcaggcgcgggauccaggacuugugaggguugccuuugauuuucugagcucucggaagugugauucccucaccaccgagcucugcacacaucgagaucuuuggcuguucuuugaucucgucuugcaggcgcgcgggauccaggagcagcgaucuuugUGAGGCUUGCCUUUGAUUCUCugagcucugggaggugugauucccucagcuccuagcuuugagagucaauugcaagccucgcacgcaucgaga
.....((((((((((((..(((((((((.(((((..(((((.((.((.((...(((((((((((((.(((((((((..((((((((((((...((((.((((((((.((((((((((((((((.((((((((.(((((...((((((((....(((((.....((((((..((..(((.(.....).)))..)))))))).......)))))))))))))...)))))..))))))))))))))))...)))))))).))))))))))))...))))))))))))..))))))))).)))))..)))))))).)).))...)).)))))))))).)))))))))..))))))))))))..........
.....((((((((((((..(((((((((.(((((..(((((.((.((.((...(((((((((((((.(((((((((..((((((((((((...((((.((((((((.((((((((((((((((.((((((((.(((((...((((((((....(((((.....((((((..((..(((.(.....).)))..)))))))).......)))))))))))))...)))))..))))))))))))))))...)))))))).))))))))))))...))))))))))))..))))))))).)))))..)))))))).)).))...)).)))))))))).)))))))))..))))))))))))..........
Structure
-----ucuuu cu u cu g --u u ccu -- u ca cac g u --- c -c uug gccu --uuucu uc aa u a
ugugaggcuugc uugauucuc gagcu gggag ug ga uc caccuccu agcuc gagaaucaa gcaagccucaca aucg cuguucuu gaucucgu cuugcagg gcgggauc aggac ugaggguu uugau gagcuc gg gug g u
|||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || ||| | u
acgcuccgaacg aacugagag uucga uccuc ac cu ag guggaggg ucgag CUCUUAGUU CGUUCGGAGUgu uagc gacgagga cuagggcg ggacguuc ugcucuag ucuug guuucuag agcua cucgag cc cac c c
agagcuacgc uu u -- g ucc u --u uc u UC uuc - c cgc - uu ucg ---- cacacgu -- ac u c
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
Unknown
Database links
Mature smo-miR1081
| Accession | MIMAT0005231 |
| Description | Selaginella moellendorffii smo-miR1081 mature miRNA |
| Sequence | 276 - UGAGGCUUGCCUUUGAUUCUC - 296 |
| Evidence |
experimental
454 [1] |
References
|
