Accession
MI0006095
Description
Selaginella moellendorffii
smo-MIR1108 precursor miRNA
Sequence
gugagucuguuuaggcaagugaauauguugcucuuguauuuguugcucuggacuaagguugccgcaaauagccuuuguaaaugccacagugguccugaugagggguuauguuucucagcucaagcccagcaugaccucuagcuccagaccuucuggaagcaaugaccuUGAGCUGAGAGACAUAACCCCccagcaggaucauuaugcugcccccaaacgcuauuugcgcuaaguauguugcacccuacuccagggcagccaauacaagagcaacauauuucacuugccuaaacauguu
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Structure
gugaguc - u cua u ----------- c -uaaau cac a a cc gcaugaccucua - c
uguuuaggcaagugaa uauguugcucuuguauu guugcucugga agg ugc cgcaaauagc uuug gc agugguccug ug gggguuauguuucucagcucaag ca gcu ccaga
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---uugu u c -ca c uuguaugaauc c ccccgu -ua g c ca ----------aa a u
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Comments
Axtell et al. report the alternative production of at least 2 miR/miR* duplexes from the MIR1108 hairpin [1]. The sequence of the most abundant clone is shown here.
Genome context
Unknown
Database links
Mature smo-miR1108
| Accession | MIMAT0005265 |
| Description | Selaginella moellendorffii smo-miR1108 mature miRNA |
| Sequence | 169 - UGAGCUGAGAGACAUAACCCC - 189 |
| Evidence |
experimental
454 [1] |
References
|
