Accession
MI0013367
Description
Arabidopsis thaliana
ath-MIR2937 precursor miRNA
Comment
The pattern of deep sequencing reads mapping to this locus does not support its annotation as a microRNA.
Literature search
1 open access papers mention ath-MIR2937
(1 sentences)
(1 sentences)
Sequence
3684
reads,
28.0
reads per million, 108 experiments
cauuuuccguuaguaaccuauuggccauUUGAUAACUCCAACAAGGACUaaucaaacgagaaccauuugaugauguuaauggugaaacacaagacccaucagcaaacucuccuccaauggucacaccacuacaaaacauuagauccuuuaaugacuccaacaaaacucuuaugaugugggugcuagugaggccaguaccguaguuaauauugauguguuuuuggucugacugucuacaaaagaaauccacaucAUAAGAGCUGUUGAAGGAGUCauuaaaagaucuaaugguuugaucauuagaggaggguuuguugaugggucguguguugcaucauuaauaucaucaaaugguucucguuuaauucguauuuguuguagucaucaaauagccaauauguuacgcuauguaccacgaaaaug
((((((((((..(((((.(((((((.(((((((.(((.(((((((.((.(((.(((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.((((((((((((((((((((((.((((((((.((((..........(((((((.((((((((((((((((...((((((((((((((((..((((.(((((((.((((((((....))).))).))..))))))).))))(((.....))).)))))))))))))))).))))...)))))))))))).))))))))))).)))))))).)))))))))))))))))))))).)))))).))))))))))))))))))))))))))))))).))).)).))))))).))).))))))).))))))).)))))...)))......)))))))
((((((((((..(((((.(((((((.(((((((.(((.(((((((.((.(((.(((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.((((((((((((((((((((((.((((((((.((((..........(((((((.((((((((((((((((...((((((((((((((((..((((.(((((((.((((((((....))).))).))..))))))).))))(((.....))).)))))))))))))))).))))...)))))))))))).))))))))))).)))))))).)))))))))))))))))))))).)))))).))))))))))))))))))))))))))))))).))).)).))))))).))).))))))).))))))).)))))...)))......)))))))
Structure
------ -ua c c A C G U c a a c c cuacaaaaca c --- aaa ----------gc g -u - - u
cauuuuc cgu guaac uauuggc auUUGAU ACU CAACAAG AC aau aaacgagaaccauuugaugauguuaauggug aacaca gacccaucagcaaacucuccuc aaugguca acca uuagauc uuuaaugacucc aaca cucuuaugaugugggu uagu aggccag ac cgu agu a
||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||
guaaaag gua cauug auaaccg uaaacua uga guuguuu ug uua uuugcucuugguaaacuacuauaauuacuac uugugu cuggguaguuguuugggaggag uuacuagu uggu aaucuag aaauuaCUGAGG UUGU GAGAAUAcuacaccua guca ucugguu ug gua uua a
caccau ucg u a c u a c a g g a u ---------- a AAG --C aagaaaacaucu g uu u g u
