Accession
MI0018192
Description
Saccharum sp.
ssp-MIR159a precursor miRNA
Literature search
1 open access papers mention ssp-MIR159a
(1 sentences)
(1 sentences)
Sequence
gaugcuuggauuugaagcggagcuccuaucauuccaaugaagggccguucugaaggguuguuccgcugcucguucaugguucccacuauccuaucucaucauguauguguguauguauuuucgagagggaggagaggagcuagacucucaugguggucgucuuugagauaggcuugugguuugcaugaccgaggagcugcaccguccccuugcuggccgcucUUUGGAUUGAAGGGAGCUCUGcauccugauccauccauc
((((..((((((.((.(((((((((((.(((.(((((.((..(((((.....(((((..((.(.(((.((((.(((((....((((...(((((((((..((((((....))))))......((((.((..(((((........))))).......)).)))))))))))))...))))....))))).)))).))).).))....)))))..)))))..)).))))).))).))))))))))).))..))))))..))))
((((..((((((.((.(((((((((((.(((.(((((.((..(((((.....(((((..((.(.(((.((((.(((((....((((...(((((((((..((((((....))))))......((((.((..(((((........))))).......)).)))))))))))))...))))....))))).)))).))).).))....)))))..)))))..)).))))).))).))))))))))).))..))))))..))))
Structure
cu -u a a u u ag uucug --uu u c g u guuc uau ucauguauguguguauguauuuuc g -----ag gag
gaug uggauu ga gcggagcuccu uca uccaa ga ggccg aaggg gu c gcu cucg ucaug ccac ccuaucuca gaga gg gagag c
|||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| || | ||| |||| ||||| |||| ||||||||| |||| || |||||
cuac accuag cu cGUCUCGAGGG AGU AGGUU cu ccggu uuccc ca g cga gagc aguac ggug ggauagagu uucu cu cucuc u
cu uc a A U U cg ---cg cugc c u g c guuu uuc ------------------------ g gguggua aga
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
Unknown
Database links
Mature ssp-miR159a
| Accession | MIMAT0020292 |
| Description | Saccharum sp. ssp-miR159a mature miRNA |
| Sequence | 223 - UUUGGAUUGAAGGGAGCUCUG - 243 |
| Evidence | not_experimental |
References
|
