Accession
MI0019806
Description
Oryza sativa
osa-MIR5794 precursor miRNA
Literature search
3 open access papers mention osa-MIR5794
(3 sentences)
(3 sentences)
Sequence
9288
reads,
6459
reads per million, 2 experiments
caucgauauggcugcaagacuguuugcgauuccccaugaaauccaaauauggaaaucaaaaggcuugaaguagauacuguuggcauacacacaaccauagaguucaucuucagaaccaaauccacguucuugaaaauaugaggagggugcugcuggaagaacaacaaucgcucaucgugauggcugcccaccauggugaccguagaaacuagcauagaaaaaaguagauaucucaagugacuuuguucauuuacguugggauagacaaguaacuaccuuuucuauuuuaguuucuauggucacuuugguggcagccaugauagacagaaacaaaggcucaccgaugaaacccaggacuugcucuacuucaagcuuauuguuuucuauauucuggauuuccUGAGGAAUCACUAGUAGUCGUucagcgauauccaug
(((.(((((.((((...(((((((.(.((((((.((.((((((((((((((((((.(((.((((((((((((((....((((.........))))......((((.(((.(((.(((...(((.(((..........))).))).))).)))..))).)))).........(((((((((((((((((.((((.((((((((((((((((((.((((((((..((((.((((((((((((..........)))).)))))))).........)))).)))))))).)))))))))))))))))).))))))))))))....................))).))))))..............)))))))))))))).))).)))))))))).)))))))).)).)))))).).)))))))...)))).))))).)))
(((.(((((.((((...(((((((.(.((((((.((.((((((((((((((((((.(((.((((((((((((((....((((.........))))......((((.(((.(((.(((...(((.(((..........))).))).))).)))..))).)))).........(((((((((((((((((.((((.((((((((((((((((((.((((((((..((((.((((((((((((..........)))).)))))))).........)))).)))))))).)))))))))))))))))).))))))))))))....................))).))))))..............)))))))))))))).))).)))))))))).)))))))).)).)))))).).)))))))...)))).))))).)))
Structure
c g caa u c c u - u a uacuguuggcauacacacaaccauagaguucaucuucagaaccaaauccacguucuugaaaauaugaggagggugcugcuggaagaacaacaaucgc - -------------------- c u c aa --------a - cuuu cau gauau gcug gacuguu g gauucc ca gaaaucca aauauggaaa caa aggcuugaaguaga ucaucg uga uggcugcc acca ggugaccguagaaacuag auagaaaa guag uaucucaa guga g ||| ||||| |||| ||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||| gua cuaua cgac CUGAUGA C CUAAGG GU cuuuaggu uuauaucuuu guu uucgaacuucaucu aguagc acu accgacgg uggu ucacugguaucuuugauu uaucuuuu cauc auaggguu cauu u c g uUG U A A c c u a -----------------------------------------------------------------------------------cguucaggacccaa c cggaaacaaagacagauagu - u u -c aaugaacag g uacu
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
Unknown
Database links
Mature osa-miR5794
| Accession | MIMAT0023261 |
| Description | Oryza sativa osa-miR5794 mature miRNA |
| Sequence | 401 - UGAGGAAUCACUAGUAGUCGU - 421 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
