Accession
MI0021369
Description
Nicotiana tabacum
nta-MIR169m precursor miRNA
Literature search
4 open access papers mention nta-MIR169m
(15 sentences)
(15 sentences)
Sequence
gaguggauugcagccaaggaugacuugccgagauguuguagccaaugcaacgacuuaucggcaggucguccuuggcuacauuucacucuuuucugcucauguaaggcucuguaagacgcauauauaguucgaggugaagucaguaauugcguuucacaaaucauauccaguugaauugaucuuaauuuguccaaagagucauugcaugaagagguagagaguggauugCAGCCAAGGAUGACUUGCCGAgauguuguagcuaaugcaacgacuuaucugcaggucguccuuggcuacauuuagcucu
((((.((.((.(((((((((((((((((.((...(((((.((....((.(((((...((((((((((((((((((((.((.(((((((((((((..((((((((((((((((.((((((((((..(.(((.....))).)..)))..))))))).))..((((..((.....))..))))..............)))))).))))))))..))).)))))))))).)).))))))))))))))))))))...))))).))....)).)))))...)).))))))))))))))))).)).)).)))).
((((.((.((.(((((((((((((((((.((...(((((.((....((.(((((...((((((((((((((((((((.((.(((((((((((((..((((((((((((((((.((((((((((..(.(((.....))).)..)))..))))))).))..((((..((.....))..))))..............)))))).))))))))..))).)))))))))).)).))))))))))))))))))))...))))).))....)).)))))...)).))))))))))))))))).)).)).)))).
Structure
- g u c c gau a caau a uua a u - gc - ------------------------------------- a -- au g g gagu ga ug agccaaggaugacuugc ga guugu gc gc acgac ucggcaggucguccuuggcu ca uucacucuuu ucu ucauguaa ggcucu gu agacgca uau a uuc a |||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||| || ||||||| ||| | ||| g cucg uu ac ucgguuccugcuggacg cu cagca cg cg uguug AGCCGUUCAGUAGGAACCGA gu aggugagaga gga aguacguu cugaga ca uuugcgu aug u aag g u a u a u auu a uaau a uag C u u ga a aaccuguuuaauucuaguuaaguugaccuauacuaaa c ua ac g u
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
Unknown
Database links
Mature nta-miR169m
| Accession | MIMAT0024679 |
| Description | Nicotiana tabacum nta-miR169m mature miRNA |
| Sequence | 229 - CAGCCAAGGAUGACUUGCCGA - 249 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
