Accession
MI0023508
Description
Sorghum bicolor
sbi-MIR6217a precursor miRNA
Sequence
3016
reads,
167.0
reads per million, 50 experiments
guagcuggcuacAAAAUAUGUUAUUCUGUAGCCACuuugaguuacgauaauuacuauauuaauuuacaagauuauauuaacuccuuacuaagugguuuacuauaacauuacgguaaauauccucauguguuauaguaacccaacuaucguaaauacauauacauauuaucguaaauuaguauauaAAAUUAUCGUAAAUAGAGGUGGCUauagaauaacauauuuuguagcuagcuac
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((((..(((((((((((((..(((.((((.......((((..(((((.((((((((((((...((.......))....)))))))))))).)).)))...))))..........)))).))))))))))))))))...)))))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((...(((((((((((..(((((((((((((..(((.((((.......((((..(((((.((((((((((((...((.......))....)))))))))))).)).)))...))))..........)))).))))))))))))))))...)))))))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
Structure
gag -ac aa u ---uaacucc -ua - u -uac ua
guagcuggcuacAAAAUAUGUUAUUCUGUAGCCACuuu uuacgauaauu uauauuaauuuac gau auau uuac agu gg uuacuauaacau gg a
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| ||| || |||||||||||| || a
caucgaucgauguuuuauacaauaagauaUCGGUGGAG AAUGCUAUUAA auaugauuaaaug cua uaua aaug uca cc aaugauauugug cc u
AUA Aau -- u cauauacaua cua a c uacu ua
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr4: 295343-295580 [+]
Database links
Mature sbi-miR6217a-5p
| Accession | MIMAT0026392 |
| Description | Sorghum bicolor sbi-miR6217a-5p mature miRNA |
| Sequence | 13 - AAAAUAUGUUAUUCUGUAGCCAC - 35 |
| Evidence | not_experimental |
Mature sbi-miR6217a-3p
| Accession | MIMAT0026393 |
| Description | Sorghum bicolor sbi-miR6217a-3p mature miRNA |
| Sequence | 186 - AAAUUAUCGUAAAUAGAGGUGGCU - 209 |
| Evidence | not_experimental |
References
|
