Accession
MI0023509
Description
Sorghum bicolor
sbi-MIR6217b precursor miRNA
Sequence
3025
reads,
135.0
reads per million, 49 experiments
uagcuacaaaauaACUUAUUUUGUAGCCACUUUGAGUUacgauaauuauuauauuaauuuauaagauuauaguaacucuuuacuaagugguuuacuauaacauuaugguaaauauccucauguguuauaguaucaaacuaucguaaauauguauacauauuaucguaaauuaguauauaAAAUUAUCGUAAAUAGAGGUGGCUacagaauaaauuauuuuguaguua
((((((((((((((.((((((((((((((((((...(((((((((((..(((((((((((((..(((.((((((((..(((((...(((((((((((((((((...((.......))....)))))))))))...)))))).)))))...)).))).))).))))))))))))))))...)))))))))))...)))))))))))))))))).))))))))))))))
((((((((((((((.((((((((((((((((((...(((((((((((..(((((((((((((..(((.((((((((..(((((...(((((((((((((((((...((.......))....)))))))))))...)))))).)))))...)).))).))).))))))))))))))))...)))))))))))...)))))))))))))))))).))))))))))))))
Structure
C GAG -au aa u - - -uc uaa --- -uau ua
uagcuacaaaauaA UUAUUUUGUAGCCACUUU UUacgauaauu uauauuaauuuau gau aua gua ac uuuac gugguu uacuauaacau gg a
|||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||| || a
auugauguuuuauu aauaagacaUCGGUGGAG AAUGCUAUUAA auaugauuaaaug cua uau cau ug aaaug uaucaa augauauugug cc u
a AUA Aau -- u a a uau --c acu uacu ua
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr5: 10851898-10852124 [+]
Database links
Mature sbi-miR6217b-5p
| Accession | MIMAT0026394 |
| Description | Sorghum bicolor sbi-miR6217b-5p mature miRNA |
| Sequence | 14 - ACUUAUUUUGUAGCCACUUUGAGUU - 38 |
| Evidence | not_experimental |
Mature sbi-miR6217b-3p
| Accession | MIMAT0026395 |
| Description | Sorghum bicolor sbi-miR6217b-3p mature miRNA |
| Sequence | 180 - AAAUUAUCGUAAAUAGAGGUGGCU - 203 |
| Evidence | not_experimental |
References
|
