Accession
MI0024406
Description
Lotus japonicus
lja-MIR7526f precursor miRNA
Sequence
2540
reads,
223.0
reads per million, 9 experiments
cuuccgcuaucuuaauagcgguaacuaccgcuaucuuaguagcgguaacuaccgcaauuaaaauagcuguaacguccgcuAUCAAGGUAGCUGUAACUUCCgcuauuuuugucuaaugcucacguuuguuguguccgcUAUCUUGAUAGCGGAAGUUACCgcuaucuugauagcggaaguuacagcuaucaagauagcggaaguuaccgcuaucuugacugcgguaguuaccgcuaucuugauugcggaag
(((((((.(((...(((((((((((((((((..((...((((((((((((.((((.(((...(((((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((.........((..((((.....))))..)).......))))))))))))))).))))))))))))))))).)))))))))))...))).)))).))))))))))))...))..)))))))))))))))))...))).)))))))
(((((((.(((...(((((((((((((((((..((...((((((((((((.((((.(((...(((((((((((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((.........((..((((.....))))..)).......))))))))))))))).))))))))))))))))).)))))))))))...))).)))).))))))))))))...))..)))))))))))))))))...))).)))))))
Structure
u uua ua uua a a aaa g U uuugucuaa cu u
cuuccgc auc auagcgguaacuaccgc uc guagcgguaacu ccgc auu auagcuguaac uccgcuAUCAAGGUAGC GUAACUUCCgcuauu ug cacg u
||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| u
gaaggcg uag uaucgccauugauggcg ag uaucgccauuga ggcg uag uaucgacauug aggcgauaguucuaucg CAUUGAAGGCGAUAG gc gugu g
u uuc uc uuc a a aac a C --UUCUAUc cu u
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
Chr4: 38981066-38981316 [-]
Database links
Mature lja-miR7526f-5p
| Accession | MIMAT0029347 |
| Description | Lotus japonicus lja-miR7526f-5p mature miRNA |
| Sequence | 81 - AUCAAGGUAGCUGUAACUUCC - 101 |
| Evidence |
experimental
cloned [1] |
Mature lja-miR7526f-3p
| Accession | MIMAT0054593 |
| Description | Lotus japonicus lja-miR7526f-3p mature miRNA |
| Sequence | 139 - UAUCUUGAUAGCGGAAGUUACC - 160 |
| Evidence |
experimental
unknown |
References
|
