Accession
MI0025320
Description
Brachypodium distachyon
bdi-MIR7709 precursor miRNA
Sequence
cugcccaauggcauUAAAGUAUGACUAGGCACACGuccuugucucaucaugagaccaacgccuugaugugacgaaaaagcuccaucuuuuaggugucggcaaggacacacccuacacccuuauuguucugugggucgugacccucguguugcuuagugccaggacauacccuauuggucgugcgggccuuggugcucacgugucuugugaaaggccaaggcccacccggccagaaggguguggcuuggagcuaggccgcgugagggccaaggcccacacgaccaaaaacgucuguccuggcccaugccucaaaguugcagcuucgucgcaucggggcacgugaggaggcagggcgUGUGCCUAGUCGUACUUUGAUggcauaaaaaaau
.......(((.((((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((((........(((((((((((((((...((((.((.((((.((((((.(((.((((((.((............(((.((((((((((.((.(((((((((.(((((((.(((((.((((((((.(((((((.(.((((((((((..(((((.....)))))...)))))))))).).))))))).)))))))).))))).))))))).))))))))).)).)))))))).)).)))....)).)))))).))).)))))).)))).)).))))))))))))))))))).))))).))))))))))))))))))))))))))))))))).)))........
.......(((.((((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((((........(((((((((((((((...((((.((.((((.((((((.(((.((((((.((............(((.((((((((((.((.(((((((((.(((((((.(((((.((((((((.(((((((.(.((((((((((..(((((.....)))))...)))))))))).).))))))).)))))))).))))).))))))).))))))))).)).)))))))).)).)))....)).)))))).))).)))))).)))).)).))))))))))))))))))).))))).))))))))))))))))))))))))))))))))).)))........
Structure
-cugccca g u a agaccaac aaa c u u c a c ccuacacccuua u - g a u g a a u c -gc u
aug cauUAAAGUAUGACUAGGCACACGuccu gucuc ucaug gccuugaugugacga agcu ca cuuu aggugu ggc aggaca ac uug uc uguggguc ug cccucgugu gcuuagu ccagg cauacccu uuggucg g gggccuuggu ucacg g
||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||| |||||| || ||| || |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| u
uac gUAGUUUCAUGCUGAUCCGUGUgcggga cggag agugc cggggcuacgcugcu ucga gu gaaa uccgua ccg uccugu ug aac ag acacccgg ac gggagugcg cggaucg gguuc guguggga gaccggc c cccggaaccg agugu c
uaaaaaaa g - g -------a --- c u c c g c --------caaa c c a c c a g a c a gaa u
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
3: 18724294-18724682 [-]
Clustered miRNAs
1 other miRNA is < 10 kb from bdi-MIR7709
| Name | Accession | Chromosome | Start | End | Strand | Confidence |
|---|
Database links
Mature bdi-miR7709-5p
| Accession | MIMAT0030135 |
| Description | Brachypodium distachyon bdi-miR7709-5p mature miRNA |
| Sequence | 15 - UAAAGUAUGACUAGGCACACG - 35 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
Mature bdi-miR7709-3p
| Accession | MIMAT0030136 |
| Description | Brachypodium distachyon bdi-miR7709-3p mature miRNA |
| Sequence | 356 - UGUGCCUAGUCGUACUUUGAU - 376 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
