Accession
MI0025346
Description
Brachypodium distachyon
bdi-MIR7730 precursor miRNA
Sequence
13560
reads,
191.0
reads per million, 21 experiments
cucgcgcauccaaauggacagaacagccacgguugaaaguuaugggaguuaauggaggacauaaugauaggaguaauuaacgguaguauaaacagucugugaaagcagaagaggcUUUUCGGUCCGGGAAUUGAUUacggucuaauacgauugguagaucuggaauuuuuuuaaaaccuagaacgaccuauagaagggggcgggagucggaagugaugaguccaccacuacuauuuuacuagcuuguauguuuucuuucuccacugauccauuauacucccuacuucccauuuuauaggucgaucuagguuauauuuuuuaccccgauucaccugucuUAUUAGUCUGUAAUCAAUUCCCUGaucaaaaaaccucuccgucuuucaugaagaccguuuacacucccacaauuuuagccuuucacuaauuccuucguuaagccacguaacuuucucccgcagcuguucuguccuucgggau
.......((((....((((((((((((..(((..((((((((((((..(((((((((((..((.(((.(((...((((...((.(((.(((((.(((((((((((..(.(((((.((((.((((.(((((((((((((((.((((((.(((.(((.((((.((........((.((((((((.(((((((((((((((((.((((((.(((((((..(((......(((((..............))).)).....)))..))))..))).....))))))...))))).)))))))))))).)))))))).))........)).)))).))).))).)))))).))))))))))))))).)))).)))).))))).)..)))))))..)))).))))).)))))...))))....))).))).))..))))))))))).)).))))))))))..)))..))))))))))))....))))
.......((((....((((((((((((..(((..((((((((((((..(((((((((((..((.(((.(((...((((...((.(((.(((((.(((((((((((..(.(((((.((((.((((.(((((((((((((((.((((((.(((.(((.((((.((........((.((((((((.(((((((((((((((((.((((((.(((((((..(((......(((((..............))).)).....)))..))))..))).....))))))...))))).)))))))))))).)))))))).))........)).)))).))).))).)))))).))))))))))))))).)))).)))).))))).)..)))))))..)))).))))).)))))...))))....))).))).))..))))))))))).)).))))))))))..)))..))))))))))))....))))
Structure
cucgcgc aaau ca uu - ag ca a u -agu aac u a a -- ca a c C C u c u a u aauuuuuu a a - --c ----c -- au uccacc - uauuuu
aucc ggacagaacagc cgg gaaaguuaug gg uuaauggagga ua uga agg aauu gg agu uaaac gucu gugaaag g agagg UUUU GGUC GGGAAUUGAUUacgg cuaaua gau ggu gauc gg ua aaccuaga cgaccuauagaa ggggg gggagu gga agug gag ac uac a
|||| |||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| || ||| ||| |||| || ||| ||||| |||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| || || |||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||| || |||
uagg ccugucuugucg gcc cuuucaaugc cc aauugcuuccu au acu ucc uuaa cc uca auuug caga uacuuuc c ucucc aaaa cuaG CCCUUAACUAAUGUC GAUUAU cug cca uuag cc au uuggaucu gcuggauauuuu cccuu cccuca ccu ucac cuu ug aug c
------- gcuu ac cu a -g ua c u gauu cac - c c ag ug c a a U U u u c c cauuuuuu a a a cau uauua ag cu -ucuuu u uucgau
Annotation confidence
Medium
Do you think this miRNA is real?
Genome context
2: 50019627-50020106 [-]
Database links
Mature bdi-miR7730-5p
| Accession | MIMAT0030194 |
| Description | Brachypodium distachyon bdi-miR7730-5p mature miRNA |
| Sequence | 116 - UUUUCGGUCCGGGAAUUGAUU - 136 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
Mature bdi-miR7730-3p
| Accession | MIMAT0030195 |
| Description | Brachypodium distachyon bdi-miR7730-3p mature miRNA |
| Sequence | 339 - UAUUAGUCUGUAAUCAAUUCCCUG - 362 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
