Accession
MI0025364
Description
Brachypodium distachyon
bdi-MIR7746 precursor miRNA
Sequence
471
reads,
3.0
reads per million, 21 experiments
uacaagagaaaauagacuaagaguuccaacagaagcuacUGUUUGGUGAAUAUGUAAAUUuucggacauuaagcauuagcacaucguauucagagcgguggucuucuucagaagcaguuugcuugaggcuuggggcuugaggggcagcuaugucauuccuagggauggaugauucuugugguaccguuuguauagaucaucguggugagaaauaugagauauggacuagaaucccaacagaaguuauucuuuggugaauccuaaggcaauuugcuuucagagauucaagugauauacuccagaaagcgauuugcuuuauguagcugaccauccacucacugaaauuaauuucacggcaaaaaaaaagcugcccccaagccccaagcaaauugauugcagaaauagaucaccugaacuucugaaaguagugugcguaagguucgauaauuuacacauucaccaaagaauaaCUUCUAUUGGAACUCUUAAUCuauguacucucaug
....((((...(((((.((((((((((((.(((((.((.(.((((((((((.((((((((.((((((...........((((((....((((((((((((((((..(((....((((((........((((((((((((.(((((((((....(((((....)))))((((((.((....((((.....))))))))))))((.(((((((((.(.((...((((...((.((((((.((((....)))))))).)).)).((((((((.((((((((.(((((((....)).)).)))..)))))))).))))))))............))))....)).).)))..)))))).))........))))))))))))))))))))).....)))))).)))..)))))))).)...)))))))....)))))).....)))))).)))))))).)))))))))).).)).))))).)))))))))))).)))))...))))....
....((((...(((((.((((((((((((.(((((.((.(.((((((((((.((((((((.((((((...........((((((....((((((((((((((((..(((....((((((........((((((((((((.(((((((((....(((((....)))))((((((.((....((((.....))))))))))))((.(((((((((.(.((...((((...((.((((((.((((....)))))))).)).)).((((((((.((((((((.(((((((....)).)).)))..)))))))).))))))))............))))....)).).)))..)))))).))........))))))))))))))))))))).....)))))).)))..)))))))).)...)))))))....)))))).....)))))).)))))))).)))))))))).).)).))))).)))))))))))).)))))...))))....
Structure
uaca aaa c c c c G A u auuaagcauua cgua --- - uc agaa ugcuugag a augucauuccuagggauggaugauucuugugguaccguuuguauagaucauc g -- a g -aua cuagaaucccaacagaaguuauucuuuggugaaucc u -a - - a
agag auaga uaagaguuccaa agaag ua U UUUGGUGAAU UGUAAAUU ucggac gcacau uucagag c gguggucu uuc gcaguu gcuuggggcuug ggggcagcu gu gugaga aau u ag ugga uaaggcaa uugcuuuc gag au uc a
|||| ||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| | || |||| |||||||| |||||||| ||| || ||
ucuc uauCU AUUCUCAAGGUU UCUUC au a aaaccacuua acauuuaa agcuug cgugug aagucuu g ccacuaga aag cguuag cgaaccccgaac ccccgucga cg cacuuu uua a uc accu auuucguu agcgaaag cuc ua ag g
guac aug A A a a g c u ------gaaug auga caa u ua ---a ---uuaaa - --------------------------------------------aaaaaaaa g aa a g acuc ------------------------accagucgaugu u ac a u u
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
2: 53185475-53185979 [-]
Database links
Mature bdi-miR7746-5p
| Accession | MIMAT0030232 |
| Description | Brachypodium distachyon bdi-miR7746-5p mature miRNA |
| Sequence | 40 - UGUUUGGUGAAUAUGUAAAUU - 60 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
Mature bdi-miR7746-3p
| Accession | MIMAT0030233 |
| Description | Brachypodium distachyon bdi-miR7746-3p mature miRNA |
| Sequence | 471 - CUUCUAUUGGAACUCUUAAUC - 491 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
