Accession
MI0025377
Description
Brachypodium distachyon
bdi-MIR7757 precursor miRNA
Sequence
uggaucaugcuucuauuuauaagcucauugaaguaacucucuccgagcucaaauaggccaauuuuuuguuugugugauaCACAAAACCUUCAGCUACCCACUUCCAUAUCAAAUCAUCUCUcuugguuuucuugucuuuuggaaauauacuuugauaugauaaaagaugagaagguagauccuagcuagaacaacaucauauuaagucuuuagucucaaguaaguccggguaggcuagagaugaaauccaauaggagcuuaacguuguuucagguaguguacaacuuguuaguaaaagaugcuuacuuguagauuaugccaaaccaugaucuauaagucaagucucuuuuacuaauaguuuugauccaccuucucaucuuuaguguuaguuaucauauuuaacuauguauucagaagauuagaagauuaugagAGAUAACUUGAUAUGUAAGUGGGUAGUUGAAUGUUUUGUUUAucaugaaaacaagaaauuagccuacgugagcccggagagaguaacucaaugagcacauaaauagaagcaugauucaaccaauagacaccgaugacgacugugaaggcaaggaaauguauuauu
((((((((((((((((((((..(((((((((.((.((((((((((.(((((..(((((.((((((((((((..((((((.(((((((.(((((((((((((((.((((((((...(((((((.(((((((((.((((((((((.(((((.((.(((((((((((((((((((((((.(((((((.((.(((((((..........((((((((((((..(......)..).)))))))))))....(((....))).......))))))).)).))).....((((.((((((((((((.((((((((((((((((((......)))))))))))))).)))).))))))))))))))))..)))).))))))))))))).........)))))))))).)).))))).)))))))))).))))))))).)))))))...)))))))).))))))))))))))).))))))).))))))..)))))))))))).)))))..))))).)))))))))).)))))))))))..))))))))))))))))))))...........((..(.((....)).).)).................
((((((((((((((((((((..(((((((((.((.((((((((((.(((((..(((((.((((((((((((..((((((.(((((((.(((((((((((((((.((((((((...(((((((.(((((((((.((((((((((.(((((.((.(((((((((((((((((((((((.(((((((.((.(((((((..........((((((((((((..(......)..).)))))))))))....(((....))).......))))))).)).))).....((((.((((((((((((.((((((((((((((((((......)))))))))))))).)))).))))))))))))))))..)))).))))))))))))).........)))))))))).)).))))).)))))))))).))))))))).)))))))...)))))))).))))))))))))))).))))))).))))))..)))))))))))).)))))..))))).)))))))))).)))))))))))..))))))))))))))))))))...........((..(.((....)).).)).................
Structure
----------------------------------------------- aa a a a aa c gu C C C AUC u u a c u --------- a cuagcuagaacaacaucauauuaagucuuuagucucaaguaaguccggguaggcuagagaugaaauccaauaggagcuuaacguuguuucagguaguguac u u - cc
uggaucaugcuucuauuuau gcucauuga gu acucucuccg gcuca uaggc aauuuuuuguuu gugaua ACAAAAC UUCAGCUACCCACUU CAUAUCAA AUCUCUc ugguuuucu gucuuuugga auaua uu gauaugauaa aagaugagaaggu gauc aacu guuaguaaaaga gcuu acuuguagauuaug a
|||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||
acuuaguacgaagauaaaua cgaguaacu ca ugagagaggc cgagu auccg uuaaagaacaaa uacuAU UGUUUUG AAGUUGAUGGGUGAA GUAUAGUU UAGAgag auuagaaga uagaagacuu uguau aa uuauacuauu uucuacucuucca cuag uuga uaaucauuuucu ugaa ugaauaucuaguac a
uuauuauguaaaggaacggaagugucagcaguagccacagauaacca ca - a c gc a ag U U U CAA u u a c u gauugugau c ---------------------------------------------------------------------------------------------------uu - c c ca
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
2: 57745334-57745931 [+]
Database links
Mature bdi-miR7757-5p.1
| Accession | MIMAT0030258 |
| Description | Brachypodium distachyon bdi-miR7757-5p.1 mature miRNA |
| Sequence | 80 - CACAAAACCUUCAGCUACCCA - 100 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
Mature bdi-miR7757-5p.2
| Accession | MIMAT0030259 |
| Description | Brachypodium distachyon bdi-miR7757-5p.2 mature miRNA |
| Sequence | 101 - CUUCCAUAUCAAAUCAUCUCU - 121 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
Mature bdi-miR7757-3p.2
| Accession | MIMAT0030260 |
| Description | Brachypodium distachyon bdi-miR7757-3p.2 mature miRNA |
| Sequence | 434 - AGAUAACUUGAUAUGUAAGUG - 454 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
Mature bdi-miR7757-3p.1
| Accession | MIMAT0030261 |
| Description | Brachypodium distachyon bdi-miR7757-3p.1 mature miRNA |
| Sequence | 455 - GGUAGUUGAAUGUUUUGUUUA - 475 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
