Accession
MI0027429
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8555 precursor miRNA
Sequence
3439
reads,
2926.0
reads per million, 2 experiments
aguuggggagagacuugcugcugacgaucuuuauuguuuuuagauuuuauuuuauauuuucaucuucaagcaacauacaccacggggccUUAUCCUGUAGAUGUCUAGUUaacucguuccuaaccaagacaaagagguuaguauugaguccauaucucuuugcuuugauuuuagaggAGUUAACUAGGCAUCUAUAGGAUGaggccuugugguguauguugugugaggaugacauaguuuugauuaauaagauuagagaugguauaaacacaaauuuagaacu
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Structure
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uuuagauuu uuuauau ucaucuuca gcaacauacaccacggggccUUAUCCUGUAGAUGUCUAGUUaacuc uu aa caag caaagaggu u
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-----------------------------------uca cac guagagauuagaauaauuaguuuugauac g g auu a c uaccug
Annotation confidence
Medium
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00011: 6531643-6531925 [+]
Database links
Mature atr-miR8555-5p
| Accession | MIMAT0058632 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8555-5p mature miRNA |
| Sequence | 90 - UUAUCCUGUAGAUGUCUAGUU - 110 |
| Evidence |
experimental
unknown |
Mature atr-miR8555-3p
| Accession | MIMAT0033826 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8555-3p mature miRNA |
| Sequence | 178 - AGUUAACUAGGCAUCUAUAGGAUG - 201 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
