Accession
MI0027455
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8571 precursor miRNA
Sequence
682
reads,
675
reads per million, 4 experiments
uuuaacacuucuccucaaacucaacuuagaagaaccaaacaaauaguucUUCAAUCGUCAAGUAUCCAUGCCUgacuaccaaacauuagaacaccaggaauugagccugacaucaucucguauaaacuaucuucuaaugagcuccccgcaaaauagaauuggaucaaacaaaauucucaagugauaaacgauuugcuguaaaugguuaccacaugcaugauaauuaauuccugcuaaaaaauuaaggacucaagaaaagaaauaaggccauaagaaagucgagaguaaggcagguauuagaaguugaauacucuugacuuucuuauauccuugggucuuuucuuggaucuuuuuucuuuuuuuguacacuuuucuauuauauuucauguguuaauuauaugcaccaaaucuuuucuugaggauuuuguuugauccauuucuauuugggguuagcuuguuggagauagcuuauauuuaauggaaucugacucaauccuaauauuugguacuguaaggcauggauauuugaggacugaagaauuaguaguuugguuuuucuaugaugaguuugagggugacuguugaa
.((((((.((.((((((((((((.(.((((((((((((((...((((((((((.((.((((((((((((((((.(((((((((.(((........((((.(((((.(.((..((((...((((((.((((((.(((((((((((((((...(((((((.((((((((((((((((((((((....(((.((((((.((((.(((((((.((((((.(..(((((.......(((.((((((..(((((.(((((((((((..(((((..((((((((((((((((((...(((.(......).)))..))))))))))))))))))..)))))..))))))))))).)))))....)))))).))).........)))))..).)))))).))))))).)))).)))))).))))))))))))))))))))))))).))))))))))))..)))))))))))))))).))))))...))))..)).).)))))))))))).)))))))..)).)))))))))))))))).)).))))))))))...)))))))))))))).).)))))))))))).)).)))))).
.((((((.((.((((((((((((.(.((((((((((((((...((((((((((.((.((((((((((((((((.(((((((((.(((........((((.(((((.(.((..((((...((((((.((((((.(((((((((((((((...(((((((.((((((((((((((((((((((....(((.((((((.((((.(((((((.((((((.(..(((((.......(((.((((((..(((((.(((((((((((..(((((..((((((((((((((((((...(((.(......).)))..))))))))))))))))))..)))))..))))))))))).)))))....)))))).))).........)))))..).)))))).))))))).)))).)))))).))))))))))))))))))))))))).))))))))))))..)))))))))))))))).))))))...))))..)).).)))))))))))).)))))))..)).)))))))))))))))).)).))))))))))...)))))))))))))).).)))))))))))).)).)))))).
Structure
u c c a u aaa A G g -- c agaacacc a c u ca cuc a u -- caa u ugau c c a c c ug --uaauucc u --uu c aa cc agg g au uuaaca uu uccucaaacuca c uagaagaaccaaac uaguucUUCA UC UCAAGUAUCCAUGCCU ac uaccaaa auu agga uugag c ga ucau guauaa cuaucu cuaaugagcu ccccg aauagaa uggaucaaacaaaauucucaag aaa gauuug ugua augguua cacaug a auaau ugc aaaaaa aagga ucaagaaaaga uaagg auaagaaagucgagagua cag u u |||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||| | || |||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | aguugu ag gggaguuugagu g aucuuuuugguuug auuaagaagu ag aguuuauagguacgga ug augguuu uaa uccu aacuc g cu ggua uauauu gauaga gguuguucga ggggu uuaucuu accuaguuuguuuuaggaguuc uuu cuaaac acgu uauuaau guguac u uauua aug uuuuuu uuucu gguucuuuucu guucc uauucuuucaguucucau guu a a a c u a u aug c g a uc a -------- - a u aa auu c - uu --- u ---- u c a u u ua ucuuuucac u cuuu a gg ua -aa g ag
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00025: 4427106-4427691 [+]
Database links
Mature atr-miR8571
| Accession | MIMAT0033853 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8571 mature miRNA |
| Sequence | 50 - UUCAAUCGUCAAGUAUCCAUGCCU - 73 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
