Accession
MI0027464
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8579 precursor miRNA
Sequence
726
reads,
642.0
reads per million, 2 experiments
ccUUCUUACACGGGGCAUCAUCaccucuaauacuggcaagauguuuauugaaucuauuuuuaguggcauuagaaauauguccacaaaauuugcacaugauuuuguuuuugucauucuugaccgaguuaacacaauacuuccauccuaaaguuuuggaaaaaaaaguuuaggaagcuucuucgaacucagauacgaaugagaaaaauaaauuaugugcaauuuuuguggacauaugccuaaugucggcauaaauugaacaucuucucgguuuuagugGUGAUGUAGCCCCGUUUAAGAAGG
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Structure
C AU u u c uugaaucu uuag aa u u g u a c aacacaaua ucca g gg
ccUUCUUA ACGGGGC CAUCacc cuaa acugg aagauguuua auuu uggcauuag auauguccacaaaa uugcacaugauuu guuuuu ucauuc ug c gaguu cu uccuaaa uuuu a
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GGAAGAAU UGCCCCG GUAGUGg gauu uggcu uucuacaagu uaaa gcuguaauc uauacagguguuuu aacguguauuaaa uaaaaa aguaag au g cucaa ga aggauuu aaaa a
U AU u u c -------- uacg cg u - g c a a -gcuucuuc ---- g aa
Annotation confidence
High
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00036: 4709046-4709345 [+]
Database links
Mature atr-miR8579-5p
| Accession | MIMAT0058661 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8579-5p mature miRNA |
| Sequence | 3 - UUCUUACACGGGGCAUCAUC - 22 |
| Evidence |
experimental
unknown |
Mature atr-miR8579-3p
| Accession | MIMAT0033863 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8579-3p mature miRNA |
| Sequence | 277 - GUGAUGUAGCCCCGUUUAAGAAGG - 300 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
