Accession
MI0027471
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8552d precursor miRNA
Sequence
1214
reads,
1111.0
reads per million, 2 experiments
auauauauauacauauaugggaaaagaugggauuagcccacuagcucguaugaacauaugagcccaauggcccagauugaaucuaggccgaucugaagaucacggaugucugguagugcuugaauuguaguuuuuuuucuacagauccaaaucacuugaaaguuuaggugugcgUUCUUCUCAUCAAGGCGCACcuaauaaaaaaauaaaaaaaauuaucugcaaaaaauaaaaugacuaaaauacccccugaaacuuuucggggguauuuggucaauuuauuucauguaaaauauuuguuugauauuuuucgaagauucaccuauuuuugaugaauacacgccuaaaauuucaagugauuuggauuuguggaaaauucaaacacuaccgaacaUCCGUGAUCGUUAGAUCGGCCCAGaauuaaucuaggacguugagcucauauguucauaugagcuaguggacuaaucccaucuuuucccuauauauauauauauau
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Structure
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auauauauaua auaua gggaaaagaugggauuag ccacuagcucguaugaacauaugagc caaug cc agauuga ucu ggccgaucuga gaucacggaugu ugguagug uugaauu uucuacagauccaaaucacuugaaa uuuaggugug gUUC AGG G
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uauauauauau uauau cccuuuucuacccuaauc ggugaucgaguauacuuguauacucg guugc gg ucuaauu aGA CCGGCUAGAUU CUAGUGCCUaca gccaucac aacuuaa aagguguuuagguuuagugaacuuu aaauccgcac uaag ucC C
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Annotation confidence
Low
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Genome context
scaffold00042: 1550291-1550789 [+]
Database links
Mature atr-miR8552d-5p
| Accession | MIMAT0058665 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8552d-5p mature miRNA |
| Sequence | 175 - UUCUUCUCAUCAAGGCGCAC - 194 |
| Evidence |
experimental
unknown |
Mature atr-miR8552d-3p
| Accession | MIMAT0033870 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8552d-3p mature miRNA |
| Sequence | 395 - UCCGUGAUCGUUAGAUCGGCCCAG - 418 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
