Accession
MI0027478
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8590 precursor miRNA
Sequence
8761
reads,
7971.0
reads per million, 2 experiments
cuacccucaucacuguucaaaguucaucgcacggucacgacugucugguaguauuauuuuucauuuuUUUUUUCUACAAAUCGGAAUGAccugaaauuugaaguauguauacaucuuagugaggcacaucuaauaaaaauauauagcaaaauaauucgugaaaaguaauugaccaaaacuuuggucaauuuuuuucauguaaaauauuuuuuugauauuuuuuauagauucgucuauuuuuuacgaauacacauucuaaauuucagguuAUUCCGAUUUGUAGAAAAAAAAAUgaaaagugaaacacuaucggauaaucgugacaguacgaucaacuauggauggugaugagaguag
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Structure
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cuac cucaucacuguuca aguu aucg ac gucacga ugucugguagu uuauuuuucauuuuUUUUU CUACAAAUCGGAAUGAccugaaauuug agu uguau aggc aucua aaaaauau uag aaaaua cgugaaaag aauugaccaa a
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a a c a a a caa - c c agcauuuuuua cu au - u aaaau - u
Annotation confidence
Medium
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Genome context
scaffold00055: 4302007-4302363 [+]
Database links
Mature atr-miR8590-5p
| Accession | MIMAT0058669 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8590-5p mature miRNA |
| Sequence | 68 - UUUUUUCUACAAAUCGGAAUGA - 89 |
| Evidence |
experimental
unknown |
Mature atr-miR8590-3p
| Accession | MIMAT0033877 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8590-3p mature miRNA |
| Sequence | 270 - AUUCCGAUUUGUAGAAAAAAAAAU - 293 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
