Accession
MI0027489
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8600 precursor miRNA
Sequence
6245
reads,
7306.0
reads per million, 2 experiments
acuauggaguaauuuaucauuguacucgauaaauuugaaaacuuacauaccguugguuuguacauggaguuuuuuuuauuaaggguauuuuuggucauuaguaggggugugACGUCAUCUACAUGGGGUGUgacgucacacuaguggcuuuuaaugcuccauguaggugaugucacAUCUCAUGUAGAUGACGUCACACCccugcuagugacaaaaaauaccuuuacuaaaacaaagcucuauauacaaaauaaggguauauaaauguccaaauuuuguugaguacaauaguaaauuacuccauagu
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Structure
c - aaaac c g g c - u g a - cuuu
acuauggaguaauuuau auuguacucgauaaa uuug uua auacc uug uuugua auggaguuuu uuuua uaaggguauuuuu gucauuaguaggggugugACGUCAUCUACAUGGGGUGUgacgucac cua gugg u
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a u cugua a g a a c c a - g ucgu
Annotation confidence
Medium
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00103: 53962-54268 [+]
Database links
Mature atr-miR8600-5p
| Accession | MIMAT0058679 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8600-5p mature miRNA |
| Sequence | 112 - ACGUCAUCUACAUGGGGUGU - 131 |
| Evidence |
experimental
unknown |
Mature atr-miR8600-3p
| Accession | MIMAT0033889 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8600-3p mature miRNA |
| Sequence | 177 - AUCUCAUGUAGAUGACGUCACACC - 200 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
