Accession
MI0027494
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8605 precursor miRNA
Sequence
764
reads,
836.0
reads per million, 2 experiments
guauacaaugagaccauuuaccauugauacaaggugguuacaauuccuuacaacuauuugaugugaaauuugauaauuuggauaugguacaaaguucgagaaauuuucuuuugaaguuugaucuuggucaaugcaauaauuguagccacccaauugcacaUCCAAUAGUCAAGAUUAAUGUGaccaccuuguaucaaaggcaacuggucucauucuauacucucuuuuuaccuuuuaugcaaugcggucacaUUAAUCUCGACCAUUGGAUguaaaguuggguggcugcaaucauucuuuugaccaagcucucaaacuucaaaagaaauuuucucaaacuuuaugacacauccaaguuaucaaaauucacaucaaauaguuguaaggaauuguaauaccuuguauaaaagguaaauggucucauucuacac
(((...((((((((((((((((.((.((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.((..(.((((((.((((((.(((((((((((((((((.(((((((((...(((.(((((((((((((((((..(((((((((.(((.((((((((((((((.(.((((((.(((((.....((................)).....))))).)))))).).)))))))))))))).))).)))))))))..))))))))))))))))).)))...)))))))))...))))))))))))))))).)))))).)))))).)..)).))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)).)))))))))))))))).)))..
(((...((((((((((((((((.((.((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.((..(.((((((.((((((.(((((((((((((((((.(((((((((...(((.(((((((((((((((((..(((((((((.(((.((((((((((((((.(.((((((.(((((.....((................)).....))))).)))))).).)))))))))))))).))).)))))))))..))))))))))))))))).)))...)))))))))...))))))))))))))))).)))))).)))))).)..)).))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)).)))))))))))))))).)))..
Structure
-- uac a g g a a gu c c u --u ugc a gc A A a c c caacu ucucauu gua aaugagaccauuuacc uu auacaaggug uuacaauuccuuacaacuauuugaugugaa uuugauaauuuggau ug a aaaguu gagaaa uuucuuuugaaguuuga cuuggucaa aau auuguagccacccaauu acaUCCAAU GUC AGAUUAAUGUGacc c uuguau aaagg gg c ||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||| || cau uuacucugguaaaugg aa uauguuccau aauguuaaggaauguugauaaacuacacuu aaacuauugaaccua ac u uuucaa cucuuu aaagaaaacuucaaacu gaaccaguu uua uaacgucgguggguuga ugUAGGUUA CAG UCUAAUUacacugg g aacgua uuucc uc u ca --c a a - a c ag a a u cuc uuc c aa C C c u u auuuu ucucaua
Annotation confidence
High
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00135: 1278150-1278580 [-]
Database links
Mature atr-miR8605-5p
| Accession | MIMAT0061214 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8605-5p mature miRNA |
| Sequence | 161 - UCCAAUAGUCAAGAUUAAUGUG - 182 |
| Evidence |
experimental
unknown |
Mature atr-miR8605-3p
| Accession | MIMAT0033894 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8605-3p mature miRNA |
| Sequence | 253 - UUAAUCUCGACCAUUGGAU - 271 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
