Accession
MI0027503
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8613 precursor miRNA
Sequence
1374
reads,
4441
reads per million, 4 experiments
aucuauaaauagaucauuuaucauuuguauaucgauguuauaauuauucuugucccuuaaauuucaaaaugggugguuguaagauuaucauugaauagacaaaguuucaaaaaaaaaaauuucagacuucgugacucaccucaagauauccaauuugacaucuaaugaguggaaaugauuaugaccuccauguacaaaagaugaggauuauaugcuaggagaccauuuaucuuuauuauaaugagguuauaauugucacuugccauuagaCAUCAAAUUGGAUGACUUGGGAUGugucauaaaguucaugauuuuuaauuauuuuuuaacuuugaguuuagucaauggcauauuuacaaccaucauauuugaaauuugauggacaagcaugauugugacuuucuuguauuaaaaguaaaugaucuuguuguauau
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Structure
auc au cauuu uc u u c aug auua a -- uc ----- uca c u c a ca --- gaa ca ca gauuauaug uauaa agaucauuuau guaua ga guuauaauuau cuugucc uuaaauuucaaa ggugguuguaag ucauuga uagac aaaguu aaaaaa aaaaauu gacuu gugac ca cucaag uauccaauuuga ucuaaug agug augauuaugaccuc ugua aaagaugag c ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| auguu ucuaguaaaug uaugu uu caguguuagua gaacagg aguuuaaaguuu cuaccaacauuu gguaacu auuug uuucaa uuuuuu uuuuuag uugaa uacug GU GGGUUC GUAGGUUAAACU agauuac ucac uguuaauauuggag auau uuucuauuu u uau gu aaaau uc u c u aua auac g ag -- auuaa uac a u A A AC cgu --- ua ua accagagga
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00007: 3482754-3483188 [+]
Database links
Mature atr-miR8613
| Accession | MIMAT0033905 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8613 mature miRNA |
| Sequence | 271 - CAUCAAAUUGGAUGACUUGGGAUG - 294 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
