Accession
MI0027504
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR8614 precursor miRNA
Sequence
372
reads,
451
reads per million, 4 experiments
uauacaaugagaccauuuacuuuugauacaaugaggucacaaucaucauuggcuguuggauuugauaucgggugguugaggauguaucauuguuugggcaccaaguccaaaaacauuucucaauuguugugucgcacuuuuaucuauuggauuucaugucCAAUAGCUAAAGUGAUUGUGACCuccuuguauaaaaaauaaauagucucauacuaua
((((..(((((((.(((((.((((.((((((.((((((((((((((..(((((((((((((.(((.(((.(((((.(((((.(((..(((..(((((((.....)))))))((((.........)))))))..))).))))).))))).))).))).))))))))))))).)))))))))))))).)))))).)))).))))).)))))))..))))
((((..(((((((.(((((.((((.((((((.((((((((((((((..(((((((((((((.(((.(((.(((((.(((((.(((..(((..(((((((.....)))))))((((.........)))))))..))).))))).))))).))).))).))))))))))))).)))))))))))))).)))))).)))).))))).)))))))..))))
Structure
ca c c g u ca u u g u a au ---------------ug a
uaua augagac auuua uuuu auacaa gaggucacaaucau uuggcuguuggau uga auc ggugg ugagg ugu cau uuugggc c
|||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||| c
auau uacucug uaaau aaaa uauguu cuCCAGUGUUAGUG AAUCGAUAACcug acu uag uuauc auuuu acg gug aaaccug a
ca a a a c -A u u g u c cu uuguuaacucuuuacaa a
Annotation confidence
High
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00007: 6003383-6003599 [+]
Database links
Mature atr-miR8614
| Accession | MIMAT0033906 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR8614 mature miRNA |
| Sequence | 161 - CAAUAGCUAAAGUGAUUGUGACC - 183 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
