Accession
MI0027509
Description
Amborella trichopoda
atr-MIR159 precursor miRNA
Sequence
121065
reads,
125695.0
reads per million, 2 experiments
uucuaugaguuguuuagauuguuggguuguguguauuuuuguaggguuguugacaugGAGCUCCUUGAGGUCCAAUCCagguucuuacuuagguaaaagcagcugcuaguucauggaucccacuguguuauuuccaaauauaagagaauggagauauaauggugguuugcaugaccaaggagcugcauucuugccuugugagauuccuugUUUGGAUUGAAGGGAGCUCUAUGuguucuccccuuccaagcuuauuuucucucucauuuauuuagcccuugaucuuuucauuuuuugaa
.((...(((.((...((((((..((((((.(((((..((((.((((..(...((((((((((((((..(((((((.(.(((.((((((..((((((((((((((.((.(.(((((.(..(((((((..((((((((............))))))))..)))))))..).))))).).)).)))))).)).)))))).))))))..))).).)))))))..))))))))))))))...)..))))..))))..)))..............)).)))))).))))))...)).)))..)).
.((...(((.((...((((((..((((((.(((((..((((.((((..(...((((((((((((((..(((((((.(.(((.((((((..((((((((((((((.((.(.(((((.(..(((((((..((((((((............))))))))..)))))))..).))))).).)).)))))).)).)))))).))))))..))).).)))))))..))))))))))))))...)..))))..))))..)))..............)).)))))).))))))...)).)))..)).
Structure
u uau u uuu uu u -------------- uu -u uu uug GA U C -u uu - - g a u g uc gu aauau uc gag ug agauug ggguug gu gua uuug aggg g acaugGAGCUCCUU GGUCCAA C agg ucuuac agguaa aa gcagcu cu g ucaug a ccacugu uauuucca a || ||| || |||||| |||||| || ||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||| |||||| || |||||| || | ||||| | ||||||| |||||||| ag uuu ac ucuagu cccgau ua uau gaac uccc c uGUAUCUCGAGGGA UUAGGUU g ucc agagug uccguu uu cgucga ga c aguac u gguggua auagaggu a a -uu u uuu -u u uuuacucucucuuu uc cu cu uug AG U u uu -u c a g a c g uu au aagag
Annotation confidence
High
Do you think this miRNA is real?
Genome context
scaffold00105: 1236832-1237130 [-]
Database links
Mature atr-miR159-5p
| Accession | MIMAT0058689 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR159-5p mature miRNA |
| Sequence | 58 - GAGCUCCUUGAGGUCCAAUCC - 78 |
| Evidence |
experimental
unknown |
Mature atr-miR159-3p
| Accession | MIMAT0033911 |
| Description | Amborella trichopoda atr-miR159-3p mature miRNA |
| Sequence | 211 - UUUGGAUUGAAGGGAGCUCUAUG - 233 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
