Accession
MI0029108
Description
Solanum lycopersicum
sly-MIR9472 precursor miRNA
Literature search
2 open access papers mention sly-MIR9472
(7 sentences)
(7 sentences)
Sequence
14079
reads,
354.0
reads per million, 82 experiments
auggguuucaauuauagcuacagaucuucccauagaucuACUCGAUUUAUUUUUCAGUAGAcguugugaauaauugauaaauacagguauacagaggucuuaauauagucagaaccuagaaauauguguaacuagauUCAGACCUUUGUACACUUGUAuucuguugcuauucacaaucucugcugaaaaaugauugacuagaucuacgaauaaucuagauuauuaaugcccgu
((((((.......((((((..((((.(((...((((((((.((((((.(((((((((((((.((((((((((..((((((((((((((.(((((((((((.(((.((((....((.((....)).))...)))).))).))))))))))).))))))))).))))).)))))))))).))))))))))))))))))).)))))))).)))..)))))).))))....))))))
((((((.......((((((..((((.(((...((((((((.((((((.(((((((((((((.((((((((((..((((((((((((((.(((((((((((.(((.((((....((.((....)).))...)))).))).))))))))))).))))))))).))))).)))))))))).))))))))))))))))))).)))))))).)))..)))))).))))....))))))
Structure
uucaauu - ac -c cca C U c au - a u a caga c g
augggu auag cu agau uuc uagaucuA UCGAUU AUUUUUCAGUAGA guugugaaua ugaua aauacaggu uacagaggucu aau uagu ac ua a
|||||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||
ugcccg uauu ga ucua aag aucuagau aguuag uaaaaagucgucu uaacacuuau guugu uuAUGUUCA AUGUUUCCAGA Uua auca ug au a
---uaau a -- au --c c - c -c c C C g -aug u a
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr8: 58966598-58966830 [+]
Database links
Mature sly-miR9472-5p
| Accession | MIMAT0035449 |
| Description | Solanum lycopersicum sly-miR9472-5p mature miRNA |
| Sequence | 40 - ACUCGAUUUAUUUUUCAGUAGA - 61 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
Mature sly-miR9472-3p
| Accession | MIMAT0035450 |
| Description | Solanum lycopersicum sly-miR9472-3p mature miRNA |
| Sequence | 138 - UCAGACCUUUGUACACUUGUA - 158 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
