Accession
MI0035608
Description
Malus domestica
mdm-MIR10988 precursor miRNA
Sequence
uggaaaacgggauacuaacaugaccagaaaccgaugucguuggacuaucgaucacaaucguguguguggauaugucucagagaagggauggaaugauuaagcguuggaaugaauuuccucugacacugccaucagucuuauagacuuauacugaagaggcaugaagaagucuauauaaaacugaugccauugucAGAGAAAAUUCAUUCCAACGCuuaaccauuccaucccuucuuugagacauucacacacaccauugugauugauaauucgacaucgguuucygaucuuguuuguauuccauuuuccaaaga
(((((((.(((((((.((((.((.(.(((((((((((((...((.(((((((((((((.(((((((((((..(((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((((((.((.(((((((..(((((((((...(((......)).)...)))))))))....))))))).)).)))))))).)))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))).))))))))))))))).).)).)))).))))))).)))))))....
(((((((.(((((((.((((.((.(.(((((((((((((...((.(((((((((((((.(((((((((((..(((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.((((((((.((.(((((((..(((((((((...(((......)).)...)))))))))....))))))).)).)))))))).)))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))).))))))))))))))).).)).)))).))))))).)))))))....
Structure
---- c u u c a uug c c ua a c c c --cu aua - aa
uggaaaa gggauac aaca ga c gaaaccgaugucg ga uaucgaucacaau gugugugugga ugucucagagaagggauggaaug uuaagcguuggaaugaauuu cucugaca ug caucagu uauagacuu c ug g
||||||| ||||||| |||| || | ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| | ||
accuuuu ccuuaug uugu cu g cuuuggcuacagc uu auaguuaguguua cacacacacuu acagaguuucuucccuaccuuac aauuCGCAACCUUACUUAAA GAGAcugu ac guaguca auaucugaa g ac a
agaa a u u a y --- a c -- c A u c aaau gaa u gg
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
MDC019830.64: 8505-8818 [-]
Database links
Mature mdm-miR10988
| Accession | MIMAT0043554 |
| Description | Malus domestica mdm-miR10988 mature miRNA |
| Sequence | 195 - AGAGAAAAUUCAUUCCAACGC - 215 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
