Accession
MI0035612
Description
Malus domestica
mdm-MIR10989d precursor miRNA
Sequence
1538
reads,
111.0
reads per million, 28 experiments
aggaagagaacaaauugcuuaaggugccauuguggcacauaaaacaccauugucauugucaaggauuugucCAAAUGUGCAAGAAGUGGCAUCcaucaauucugcgacaaaaaagaccuugaugucgagaaggucaaggucaugcccaccgguguaaggaucgacugauauugaaagcuuuguggcuucccauuauccucauuauccccauuaucuacuaacgacccauagauagauaauggggagccaaCAAAGCUUUUAAUAUCAGUCGAuccucacaccggcggguaagaccuugaacucaucgauaucaaggccuuucuucuuguagaauugauggaugacacuucuugcgcauuuggacaaaucuuuaaggaugucaaugguguuuucgugccacaguggcaccuuaagcagcuuguucucuuccucucuccuuaa
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Structure
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aggaagagaacaa uugcuuaaggugccauuguggcac aaaacaccauug cauu u aaggauuugucCAAAUGUGCAAGAAGUG CAUCcaucaauucugcga aa aaag ccuugaugucga ag ucaagguc ugccc ccggugu aggaucgacugauauugaaagcuuugu ggcuucccauuauc uaucua c
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Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
MDC018873.313: 4550-4990 [-]
Clustered miRNAs
2 other miRNAs are < 10 kb from mdm-MIR10989d
| Name | Accession | Chromosome | Start | End | Strand | Confidence |
|---|
Database links
Mature mdm-miR10989d-5p
| Accession | MIMAT0056765 |
| Description | Malus domestica mdm-miR10989d-5p mature miRNA |
| Sequence | 72 - CAAAUGUGCAAGAAGUGGCAUC - 93 |
| Evidence |
experimental
unknown |
Mature mdm-miR10989d-3p
| Accession | MIMAT0043558 |
| Description | Malus domestica mdm-miR10989d-3p mature miRNA |
| Sequence | 251 - CAAAGCUUUUAAUAUCAGUCGA - 272 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
