Accession
MI0035664
Description
Malus domestica
mdm-MIR11011a precursor miRNA
Sequence
aggacuuguauauaucauugcauuuucugaaaaaguaugcauccggaacaugguguuuggauaaacuugguaagauccuucaauguaaagaauuuucaaagaaaugaaaaguucggcaaauuuuuuacaaggugaaucgcggaagcacaaaaaucaaaagaaaauuuugcuacuucuaagggauucagcuugugaaaaauagaucaaaucuuuuguugcuuugaauauuauuuacacuaaggauauuagcAAGUUCAUUCAAACACCAUGUuaaggaugcauaauuuucacaaaauacaaugauucaaguccuugacucc
((((((((.....(((((((.(((((.((((((..(((((((((..((((((((((((((((.((((((.(((.((((((...((((((.(((.(((((((.(((((((.(((.((...((((((((((((.((((((.((((((..(((((.((....))...)))))...)))))..).)))))).))))))))))))...)).))).))))))).))))))).))).))))))..)))))).))).)))))).))))))))))))))))..))))))))).)))))).))))).))))))).)))))))).......
((((((((.....(((((((.(((((.((((((..(((((((((..((((((((((((((((.((((((.(((.((((((...((((((.(((.(((((((.(((((((.(((.((...((((((((((((.((((((.((((((..(((((.((....))...)))))...)))))..).)))))).))))))))))))...)).))).))))))).))))))).))).))))))..)))))).))).)))))).))))))))))))))))..))))))))).)))))).))))).))))))).)))))))).......
Structure
------- uauau c c ag gg a g g caa g u a a c caa g g -- -ca --a a
aggacuug aucauug auuuu ugaaaa uaugcaucc aacaugguguuuggau aacuug uaa auccuu uguaaa aau uucaaag aaugaaa guu gg auuuuuuacaag ugaauc c ggaag caaaa uc a
|||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||
uccugaac uaguaac uaaaa acuuuu auacguagg uUGUACCACAAACUUA UUGAAc auu uaggaa acauuu uua aaguuuc uuguuuu uaa cu uaaaaaguguuc acuuag g ucuuc guuuu ag a
ccucagu ----u a c -a aa C g a -uc a u g c a aga g g aa auc aaa a
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
MDC010208.312: 29966-30285 [-]
Database links
Mature mdm-miR11011a
| Accession | MIMAT0043613 |
| Description | Malus domestica mdm-miR11011a mature miRNA |
| Sequence | 251 - AAGUUCAUUCAAACACCAUGU - 271 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
