Stem-loop aof-MIR12146

Accession

MI0040523

Description

Asparagus officinalis aof-MIR12146 precursor miRNA

Sequence

guguguaucugcgguguaucugcugcagauacacagcaguguaucuguaguagauacacagcuguguguaucugcagauacacaguaguguguaucuaauagguaucuacagauacacacagcuguguaucuucuacagauacacugcuguguaucuauagcagauacacagcaguguaUCUGCAGUAGAUACACACUGcagauacaca
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Structure

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 acacauagacGUCACA  UAGAUGACG                                                                                                                                        UCUaugug c
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Annotation confidence Not enough data

Genome context

KV863678.1: 38538-38746 [-]

Mature aof-miR12146

• Accession: MIMAT0049729
• Description: Asparagus officinalis aof-miR12146 mature miRNA
• Sequence: 180 - UCUGCAGUAGAUACACACUG - 199
• Evidence: experimental ; Illumina [1]

References

1. PubMed ID: 29093472
   The asparagus genome sheds light on the origin and evolution of a young Y chromosome
   Harkess A, Zhou J, Xu C, Bowers JE, Van der Hulst R, Ayyampalayam S, Mercati F, Riccardi P, McKain MR, Kakrana A, Tang H, Ray J, Groenendijk J, Arikit S, Mathioni SM, Nakano M, Shan H, Telgmann-Rauber A, Kanno A, Yue Z, Chen H, Li W, Chen Y, Xu X, Zhang Y
   Nat Commun (2017) 8:1279