Accession
MI0014628
Description
Arabidopsis lyrata
aly-MIR862 precursor miRNA
Gene family
MIPF0001145;
MIR862
Sequence
35
reads,
1220
reads per million, 1 experiments
acaauuauggaaugacaagcauguacugaaacugagaguauaugggcacuguguccaacugaaagagaaaagacacaaaguuuccuuauaaauacaguacaaaucacaaguucagccaucuuauauguacaguaaucuUCCAAUAGGUCUAGCAUGUGCugaaacuguguguuguguguacaauguucucauauacacacaguuucagcACAUGCUGGAUCUACUUGAAGacuacuguucuuauaagguacugaacuuguuaucuguacuguguauauaugagaucucuguauucuugcucuuuuaguuugacacuuuguucucauauacacucgguuucagcacaugcuugacuuacuugcuugu
...............(((((((((.(((((((((((.(((((((((.((.(((((.(((((((((((..((((.(((.((((((..((((.((((((((((.((.((((((((((..((((((((.(.((((((.(((((...(((((((((((((((((((((((((((((.(((((...........))))))))))))))))))))))))))))))))))...))))).)))))).).)))))))).)))))))))).)).)))))))))).)))).)))).)).)))..)))).))))))))))).)))))...)).))))))))).))))))))))).)))))))))..............
...............(((((((((.(((((((((((.(((((((((.((.(((((.(((((((((((..((((.(((.((((((..((((.((((((((((.((.((((((((((..((((((((.(.((((((.(((((...(((((((((((((((((((((((((((((.(((((...........))))))))))))))))))))))))))))))))))...))))).)))))).).)))))))).)))))))))).)).)))))))))).)))).)))).)).)))..)))).))))))))))).)))))...)).))))))))).))))))))))).)))))))))..............
Structure
acaauuauggaauga a a c --u c aa -c a - cu a a c cc u u a CAA u uaca
caagcaugu cugaaacugag guauauggg ac guguc aacugaaagag aaga aca ag uuuc uaua auacaguaca au acaaguucag aucuuaua g acagua ucuUC UAGGUCUAGCAUGUGCugaaacugugugu gugug a
||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||| || |||| |||| |||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| u
guucguaca gacuuuggcuc cauauacuc ug cacag uugauuuucuc uucu ugu uc agag auau ugugucaugu ua uguucaaguc uggaauau c ugucau aGAAG AUCUAGGUCGUACAcgacuuugacacaca uauac g
-uguucguucauuca c a u uuu u -g ua c u -u a c u -a u u c UUC - ucuu
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
GL348716.1: 3826645-3827010 [+]
Database links
Mature aly-miR862-5p
| Accession | MIMAT0017653 |
| Description | Arabidopsis lyrata aly-miR862-5p mature miRNA |
| Sequence | 139 - UCCAAUAGGUCUAGCAUGUGC - 159 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1], SOLiD [2] |
Mature aly-miR862-3p
| Accession | MIMAT0017654 |
| Description | Arabidopsis lyrata aly-miR862-3p mature miRNA |
| Sequence | 210 - ACAUGCUGGAUCUACUUGAAG - 230 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1], SOLiD [2] |
| Database links |
|
References
|
