Accession
MI0001759
Description
Saccharum officinarum
sof-MIR159e precursor miRNA
Gene family
MIPF0000010;
MIR159
Literature search
7 open access papers mention sof-MIR159e
(39 sentences)
(39 sentences)
Sequence
cugaugcuuggauuugaagcggagcuccuaucauuccaaugaagggccguucugaagggugguuccgcugcucguucaugguucccacuauccuaucucaucauguauguguguauguauuuucgagagggaggagaggagcuagacucucacgguggucgucuuugagauaggcuugugguuugcaugaccgaagagcugcaccguccccuugcuggccgcucUUUGGAUUGAAAGGAGCUCUUgcaucugauccauccaucc
..((((..((((((.((.(((((((((((.(((.(((((.((..(((((.....(((((((((.(.(((..(((.(((((....((((...(((((((((..((((((....)))))).(((((....)))))(((((........)))))(((.....)))...)))))))))...))))....))))).)))..))).).))))..)))))..)))))..)).))))).))).)))))))).))).)).))))))..)))).
..((((..((((((.((.(((((((((((.(((.(((((.((..(((((.....(((((((((.(.(((..(((.(((((....((((...(((((((((..((((((....)))))).(((((....)))))(((((........)))))(((.....)))...)))))))))...))))....))))).)))..))).).))))..)))))..)))))..)).))))).))).)))))))).))).)).))))))..)))).
Structure
cu cu u a - a u u ag uucug -- u c gc u guuc uau ---------------------------------------------uc g gaug uggauu ga gcg gagcuccu uca uccaa ga ggccg aaggg uggu c gcu ucg ucaug ccac ccuaucuca auguau u |||| |||||| || ||| |||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||| | ||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||| cuac accuag cu cgU CUCGAGGA AGU AGGUU cu ccggu uuccc gcca g cga agc aguac ggug ggauagagu uguaug g -c cu u a U A U U cg ---cg cu c u ga c guuu uuc uucugcugguggcacucucagaucgaggagaggagggagagcuuuua u
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
Unknown
Database links
Mature sof-miR159e
| Accession | MIMAT0001661 |
| Description | Saccharum officinarum sof-miR159e mature miRNA |
| Sequence | 225 - UUUGGAUUGAAAGGAGCUCUU - 245 |
| Evidence | not_experimental |
References
|
