Accession
MI0001767
Description
Saccharum officinarum
sof-MIR408c precursor miRNA
Literature search
9 open access papers mention sof-MIR408c
(90 sentences)
(90 sentences)
Sequence
agaagauggguaugguuggagacagggaugaggcagagcaugggauggggccaucaacaaaauuuccaauuucuguccuccgcuaggccgcuacugcauuucuguuugcuugcucacaaaacggagggauuugugagaguuaucaggcagaaagaacaaagaaggugccucccuggugaaguggugauggccugaccugagagggcugagagcucagcugguguccugguguuguugcuuccucccCUGCACUGCCUCUUCCCUGGCuccccaccguugcccuugc
.......(((((((((.((((.((((((.(((((((.(((.((((.(((((((((((((..........((((.((((((((.(((((((.((((((.((((((((((....((((((((.(.....).))))))))......)))))))))).............(((.....)))...)))))).)))))))...)).)))))).))))..........)))..))))).....))))).)))).))).))))))).)))))).))))..)))).)))))....
.......(((((((((.((((.((((((.(((((((.(((.((((.(((((((((((((..........((((.((((((((.(((((((.((((((.((((((((((....((((((((.(.....).))))))))......)))))))))).............(((.....)))...)))))).)))))))...)).)))))).))))..........)))..))))).....))))).)))).))).))))))).)))))).))))..)))).)))))....
Structure
agaagau - -u a u a u u ----- -- aaauuuccaa u - --c c --------------------------a --cuug a g
gggua uggu ggag caggga gaggcag gca ggga ggggc cauca aca uuuc guccuc cg uaggccg uacugc uuucuguuug cucacaaa c g
||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| |||| |||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | a
cccgu gcca ccuC GUCCCU CUCCGUC CGU cccu cuucg guggu ugu agag cgggag gu guccggu guggug aaagacggac gaguguuu g g
---cguu u cc G U A C c uuguu cc ggucgacucg u a cca a aaguggucccuccguggaagaaacaag uauuga a g
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
Unknown
Database links
Mature sof-miR408c
| Accession | MIMAT0001669 |
| Description | Saccharum officinarum sof-miR408c mature miRNA |
| Sequence | 247 - CUGCACUGCCUCUUCCCUGGC - 267 |
| Evidence | not_experimental |
References
|
